R语言绘图—一键添加显著性

最新推荐文章于 2024-04-16 10:09:10 发布
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分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言 开发语言
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本文介绍了R语言中使用ggsignif包为箱式图添加显著性检验的方法，包括数据模拟、箱式图绘制以及自定义显著性标志的展示，如更改线条颜色和长度。通过学习此方法，可以更方便地在图形中呈现统计学比较的结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

今天再为大家介绍一个一键添加显著性的ggsignif包。所谓技多不压身，多学习一些便捷技能，能为我们更好的应对更多绘图场景。那么大家先自行安装ggsignif包，安装好了我们就开始吧。

一、数据模拟
我们假设做了三组实验，A组为对照组，B、C分别为实验组，数据如下：


mydata <- data.frame(
  name=c( rep("A",400
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R语言ggplot2可视化箱图并使用ggsignif添加分组显著性标签
PixelLogic的博客
08-17 691
comparisons参数指定了需要进行比较的组别对，map_signif_level参数用于在图形中显示显著性水平，textsize参数用于设置标签的字体大小。例如，vjust参数用于调整标签的垂直位置，tip_length参数用于调整箭头的长度，color参数用于设置标签的颜色，size参数用于调整标签的粗细，linetype参数用于设置标签的线型。通过以上的代码和解释，我们可以很容易地使用ggplot2和ggsignif包来可视化箱图并添加分组显著性标签。运行上述代码后，我们可以得到一个简单的箱图。
使用ggsignif进行统计分析和绘图（R语言）
ByteJolt的博客
08-27 249
其中，ggsignif包是一个强大的工具，它允许我们在ggplot2图形上添加显著性标记，以突出显示不同组之间的差异。然后，使用一个示例数据集创建了基本的图形，并使用ggsignif包添加了显著性标记。comparisons参数指定了我们要比较的组合，这里我们比较了药物A和药物B的疗效差异。你可以根据自己的数据和需求进行相应的修改和调整，以满足特定的分析和可视化需求。在上述代码中，我们使用ggplot2创建了一个箱线图，其中x轴表示药物组，y轴表示疗效。首先，我们需要使用ggplot2创建一个基本的图形。
R统计绘图-多变量单因素非参数差异检验及添加显著性标记图
qq_39859424的博客
04-27 1420
一、 数据准备 数据包括36个样本，4个处理，7个环境因子，研究目的是为了比较处理间每个环境因子是否存在差异。 # 1.1 设置工作路径 setwd("D:\\EnvStat\\stat") getwd()#获取工作路径 # 1.2 导入数据 env = read.csv("env.csv",header = TRUE,row.names = 1,stringsAsFactors = FALSE) dim(env) head(env) # 第一列为分组信息，2-8列为环境因子数据 图1|环境
R语言中使用ggplot2绘制散点图箱线图，附加显著性检验
青笋的博客
12-22 7996
这段代码的作用是创建一个箱形图，显示不同物种（Species）的萼片宽度（Sepal.Width）分布，且不同物种的箱形用不同颜色表示，并且这些颜色半透明。对于两组以上的独立样品，如果数据同时满足正态性和方差齐性，可以采用方差分析（ANOVA）或者Kruskal检验，如果不满足可采用Kruskal检验。本篇笔记主要内容：介绍R语言中绘制箱线图和散点图的方法，以及二者结合展示教程，添加差异比较显著性分析，绘制如上结果图。这张图x轴是不同分类，每个分类下有A和B两组，y轴表示具体的值，每个分类上有P值标注。
探索`ggsignif`: 在ggplot2中添加显著性标记的利器
最新发布
gitblog_00076的博客
04-16 854
探索ggsignif: 在ggplot2中添加显著性标记的利器 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gg/ggsignif ggsignif是一个R语言中的开源包，它为流行的图形库。 技术分析 ggsignif的核心功能是生成一个geom_signif()几何对象，这个对象可以无缝地插入到任何ggplot2图层中。该函数接受比较的组对、置信水平和统计测试的结果，...
用计算机图形学画字母,r 语言快速出图——单因素方差带字母显著性标记
weixin_35906775的博客
06-26 1487
相信带字母的显著性标记图大家都不会陌生，在许多文献中多可以看到类似的图。首先来看看它长啥样用不同的字母来表示显著性，字母相同不显著不管是在月末组会汇报，还是自己写文章过程中都会用到。今天就一起来学一下怎么做。首先学一个概念数据可视化，可视化：可视化(Visualization)是利用计算机图形学和技术，将数据转换成图形或图像在屏幕上显示出来，再进行交互处理的理论、方法和技术。大概意思就是说一图胜千...
可视化绘图技巧100篇分析篇（二）-生存曲线（LM曲线）（补充篇）
getusushu的博客
05-09 1273
K-M曲线——研究某因素与生存结局（阳性事件）及时间是否相关相比于之前使用的寿命表法（Life-table method），这种方法更加充分地利用了信息，给出更准确的统计量。因此，K-M曲线也成为了生存分析中最常用的方法之一。当我们需要描述生存分析数据时，我们常常使用生存曲线来展示，这个时候需要估计每个时间点位的生存率，用的就是K-M方法。如果随访时间足够长、生存结局理论上均为1（发生阳性事件），但实际研究中，不一定所有研究对象在随访过程中均出现了阳性事件，此类患者的生存结局是0。
深度学习系列资料总结
热门推荐
专注大数据与人工智能技术分享，欢迎私信加群互相学习！
07-17 2万+
说明本系列深度学习资料集合包含机器学习、深度学习等各系列教程，主要以计算机视觉资料为主，包括图像识别、分类、检测、分割等，内容参考Github及网络资源，仅供个人学习。深度学习定义一般是指通过训练多层网络结构对未知数据进行分类或回归深度学习分类有监督学习方法——深度前馈网络、卷积神经网络、循环神经网络等；无监督学习方法——深度信念网、深度玻尔兹曼机，深度自编码器等。手写机器学习笔记github机器学习算法公式推导以及numpy实现github人工智能相关术语link。..................
数据中台建设方案-基于大数据平台
2301_76549664的博客
03-14 4570
通过对客户大数据应用平台服务需求的理解，根据建设目标、设计原则的多方面考虑，建议采用星环科技Transwarp Data Hub（TDH）大数据基础平台的架构方案，基于Transwarp Operating System（简称TOS）云平台方式部署构建。 通过建立大数据集成平台、大数据计算平台、大数据开发平台及大数据运维平台来满足客户大数据应用平台服务建设的要求。
【R绘图】ggsignif-假设检验
陈有朴的博客
06-22 5219
以鸢尾花数据集为例的ggsignif packages使用
ggsignif:轻松将重要性括号添加到您的ggplots中
03-26
ggsignif：“ ggplot2”的重要性括号 描述 该软件包提供了一种简单的方法来指示两组是否显着不同。 通常，这是通过顶部的条形图显示的，该条形图连接了感兴趣的组，而这些组本身已注有重要程度（NS，*，**，***）。 该软件包提供了一个单层（ geom_signif ），该层将各组进行比较和测试（t.test，wilcox等），并将注释添加到绘图中。 例子 安装套件 install.packages( " ggsignif " ) # Or for the latest development version remotes :: install_github( " const-ae/ggsignif " ) 情节意义 library( ggplot2 ) library( ggsignif ) ggplot( mpg , aes( class , hwy )) + geo
如何在R语言中添加显著性标记来改进绘图效果
code88888的博客
08-27 403
通过使用文本标注、箭头和线段等方法，我们可以在R语言中方便地添加显著性标记，以改进数据可视化效果。在数据可视化中，添加显著性标记是一种常见的技巧，可以帮助观察者更好地理解数据的特征和趋势。下面是一个简单的示例，演示如何在散点图中添加显著性标记。下面是一个示例，演示了如何在折线图中添加显著性标记。下面是一个示例，展示了如何在柱状图中添加显著性标记。在上面的代码中，我们首先创建了一些示例数据，然后使用。函数在指定的位置添加了一个红色的星号，使用。函数在指定的位置添加了一个红色的星号，使用。
使用R语言添加显著性标记【文章Fig复现】
鬼话
06-05 2940
使用R语言添加显著性标记【文章Fig复现】
forest-森林图：分组回归系数可视化
Stata连享会
09-17 1217
全文阅读：forest-森林图：分组回归系数可视化| 连享会主页 目录 1. 问题背景 2. Stata 实例 2.1 Stata 外部命令介绍 2.2 Stata 实例 参考文献 1. 问题背景 绘制森林图可以帮我们直观地展现不同系数的大小和显著性，便于我们比较不同系数的相对大小关系 例如下图研究中国新型农村社会保险覆盖对于养老金领取的影响，通过森林图我们可以直观地看出政策影响在不同群体之间的差异。 全文阅读：forest-森林图：分组回归系数可视化| 连享会主
Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
weixin_39556044的博客
10-08 1万+
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。 Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。 ​ 之前分享过绘制KM曲线R|生存分析（1），诺莫图展示COX结果Nomogram（诺莫...
用R语言画一个简单的箱型图
胸卡的博客
01-09 1019
用R语言画一个简单的箱型图 经朋友介绍，第一次写博客，留一段文字，记录一下这个瞬间。 #计算天尺度的Q10值 Daytime <- c(1.45, 1.40, 1.37, 1.33, 1.45, 1.30) Nighttime <- c(1.40, 1.35, 1.37, 1.36, 1.40, 1.37) Diurnal <- data.frame(Daytime, Nighttime) Diurnal library(reshape2) dfDay <- melt(Diurn
ggplot2+ggsignif绘制箱图及添加显著性
lover_of_sci的博客
06-13 4947
ggplot2+ggsignif绘制箱图及添加显著性 library(ggplot2)#加载ggplot2包 library(ggsignif)#加载显著性包 setwd(‘d:’)#设置工作路径 da<-read.table(‘ahga.txt’,header = TRUE,sep = ‘\t’,stringsAsFactors = T)#读取文件，保持标题，保持因素型变量 head(da)#展示前几行数据 compire<-list(c(‘A’,‘B’),c(‘A’,‘C’),c(‘B’,‘
ggplot2绘制分组小提琴图并添加统计学显著性标识
arrhythmia08的博客
12-20 5558
ggplot2绘制分组小提琴图并添加统计学显著性标识
R语言ggplot2可视化小提琴图（violin plot）并使用ggsignif添加分组显著性（significance）标签
data+scenario+science+insight
12-05 2103
R语言ggplot2可视化小提琴图（violin plot）并使用ggsignif添加分组显著性（significance）标签
R语言实现SCI科研显著性气泡图的快速绘制
资源摘要信息:"R语言绘制SCI科研显著性气泡图源代码.zip" 知识点一：R语言基础 R语言是一种用于统计分析、图形表示和报告的编程语言和软件环境。它适用于数据挖掘、机器学习等多种数据分析场景，特别是在科研领域，...
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