simplot 画热图 R 语言

如果我们在R里打命令fortunes::fortune(59)，你将看到以下的输出：

Let’s not kid ourselves: the most widely used piece of software for statistics
is Excel.
— Brian D. Ripley (‘Statistical Methods Need Software: A View of Statistical Computing’)
Opening lecture RSS 2002, Plymouth (September 2002)

曾经有人问我，用R画热图怎么改颜色，我的回答是无能为力（没说怎么画，我怎么能够知道怎么改）。孔乙己老先生告诉我们回字有四样写法，而R画热图，岂止4种。基于base graphics有stats::heatmap, gplots::heatmap.2，以及多个包实现的heatmap.3。交互式的热图有heatmaply、d3heatmap和iheatmapr等包。

对于R代码无感的话，还有shinyheatmap，直接提供交互式的网页操作界面。

基于grid graphics比较有名的有pheatmap和ComplexHeatmap包，要论复杂性，ComplexHeatmap最厉害，要论简单而且也还比较漂亮，那就pheatmap了。而且基于grid，也是保障了后续的操作，而且现在整个grid的生态最好，各种辅助的包太强大。

比如我这样画一个热图：

d = data.