R语言如何绘制弦图

在R语言中,您可以使用circlize包来绘制弦图。弦图是一种可视化方法,用于展示两个或多个类别之间的关系。在弦图中,每个类别表示为一个扇形,而类别之间的关系表示为连接它们的弦。

以下是使用R语言和circlize包绘制弦图的步骤:

  1. 安装并加载circlize包。您可以使用以下代码安装该包:
install.packages('circlize')
library(circlize)
  1. 准备数据。弦图需要一个矩阵来表示不同类别之间的关系。例如,假设您有四个类别A、B、C和D,它们之间的关系如下:
  A B C D
A 0 3 1 2
B 3 0 5 1
C 1 5 0 4
D 2 1 4 0

则可以将该矩阵存储为一个名为m的变量。

  1. 绘制弦图。使用以下代码绘制弦图:
set.seed(999)
mat = matrix(sample(18, 18), 3, 6)
rownames(mat) = paste0("S", 1:3)
colnames(mat) = paste0("E", 1:6)

df = data.frame(from = rep(rownames(mat), times = ncol(mat)),
                to = rep(colnames(mat), each = nrow(mat)),
                value = as.vector(mat),
                stringsAsFactors = FALSE)

chordDiagram(m)

这将绘制一个基本的弦图,其中每个类别表示为一个扇形,而类别之间的关系表示为连接它们的弦。

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