MIMICIV中SOFA评分计算（WINDOWS）

首先声明，这篇的操作有许多需要手动的地方，不能一键生成，也希望以后能有更快捷的手法。
之前讲了MIMICIV数据库在PostgreSQL中的安装，今天主要是讲在pgAdmin中调整原代码并生成SOFA评分。

0. 谋定而后动

在pgAdmin中选中数据库，右键选择Query Tool，接着打开sofa.sql

可以看到，除了原生数据之外，sofa评分还使用了icu_hourly, ventilation, vitalsign等衍生数据，如下表：

SOFA	需要的衍生数据	衍生数据需要的衍生数据
	icu_hourly	icu_times
	ventilation	ventilator_setting, oxygen_delivery
	vitalsign
	gcs
	enzyme
	chemistry
	complete_blood_count
	urine_output_rate	urine_output, weight_duration
	epinephrine
	norepinephrine
	dopamine
	dobutamine

如果说sofa.sql是个大BOSS的话，表中的内容就是打BOSS前刷的小怪，要把对应的sql一个一个运行，生成衍生的数据，都准备齐活了才能运行sofa.sql

1. Postgres的时间函数

由于MIMICIV官方给的SQL语句是适用于BigQuery的，因而有些function在PostgreSQL中没有。好在MIMICIII的代码中提供了这些function.
https://github.com/MIT-LCP/mimic-code.git

用pgAdmin打开postgres-function.sql后，把SET search_path TO mimiciii;删除并运行。
这样就可以在PostgreSQL中使用这些function了；不过，也可以修修改改，使用Postgres中的原生时间函数，具体见我另一篇文。