fMRI预处理工具
按照之前文章的介绍,该部分将主要介绍SPM与DPABI的处理流程,希望可以方便大家的学习。
SPM | DPABI | |
---|---|---|
优点 | 便于了解数据处理的工作原理 | 简单,可执行批处理,任意中断处都可以开始 |
缺点 | 产生较大的数据量 | 没有缺点诶 |
SPM
界面介绍
- 数据预处理窗口
- 统计处理窗口
- 小工具窗口
- 处理执行过程界面
- 图形界面
处理过程
参见
DPABI
界面介绍
- Command命令行打开DPAB|
2. 点击 DPARSF4.5
3. 选择 DPARSF Advanced Edition, 处理界面如下
处理过程
数据导入
由于DPABI是批处理话执行,操作过程如下图所示。
- 首先将模板更换为一个Blank Template
- 其次选择文件存储路径
- 然后查看扫描信息Excel文件或者通过使用MRIcron.exe程序,查看影像数据的具体信息,可以获得Slice number以及Time points的个数。
- 填入Starting Directory Name,文件夹的名字可以任意取,不过推荐命名为FunRaw,该文件夹见名知意,存储的是原始的DICOM数据文件。输入文件名之后,点击回车按钮,在Participants自动弹出参与被试的文件。注意:FunRaw文件夹中必须包含不同Session的DICOM文件
- 在导入Participants的环节中除了将这个FunRaw文件夹中的所有被试导入,还可以将指定的被试导入。
- 在前面操作的基础上,创建指定导入处理的被试文件夹编号或者名称的(txt)文件,然后选择Load participant ID from a text file
注意DPARSFA数据导入基本原则
- 如果是原始DICOM数据,需要在根目录下建立FunRaw文件夹, 里面存放 S u b 1 , S u b 2 , … , S u b n Sub_1, Sub_2,…,Sub_n Sub