【Compute Canada】Running_jobs

增长了一个新知识分享一下：

 

之前在Compute Canada submit job的时候，喜欢用sbatch job.sh

昨晚跟老师meeting时候，学到了一个新的方式interactive jobs

交互式 "控制台工具"，如R和iPython
重要的软件开发、调试或编译
可以用salloc在一个计算节点上启动一个交互式会话

在下面的例子中，请求两个任务，对应于两个CPU核心，时间为一小时。

salloc --time=1:0:0 --ntasks=2 --account=def-someuser

time= 输入自己需要的时长

ntasks= 任务数

account= 账户名

然后系统会为我们申请资源 

申请到了以后我们就可以使用R 或者module load r 进R的界面了（python类似）

退出当前交互界面只需要命令：exit

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补充一下并行计算在sbatch时候的命令

step1: R Script文件中添加

args <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)  # 此时 输入的第一个参数就是程序的第一个参数
ss <- as.numeric(args[1])# 参数名ss

step2: 在终端登录computecanada账号

for ii in {1..100}; do sbatch job.sh $ii; done

这样就把1:100传递给R中的ss

注意save的时候给一个ss参数（不然会覆盖先运行出来的结果）

写在后面：

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