在使用ribodiff进行TE分析的时候,出现下方报错:
Traceback (most recent call last):
File ".\TE.py", line 81, in <module>
main()
File ".\TE.py", line 33, in main
data = FileIn.parse_expt()
File "Lib\site-packages\ribodiff\loadinput.py", line 74, in parse_expt
seqType = np.unique(self.exper[:, 1])
IndexError: too many indices for array
检查所使用的文件格式和要求都没有问题之后,发现问题出在conda安装的软件并不适用我的系统
bioconda / ribodiff 0.2.2 linux-64 noarch osx-64
以上三种可以用,但是我是windows所以不能,然后找到git里面作者的install
https://github.com/ratschlab/RiboDiff/blob/master/INSTALL
按照步骤进行安装