为什么要记录TwoSampleMR的安装过程呢?因为这个包足足安装了1个半小时
还是有一些没有解决的问题,比如
Timeout was reached: [api.github.com] Resolving timed out after 10000 milliseconds
以及
Could not resolve host: api.github.com
有帖子说可以用httr包修改代理,但我实在不懂代理是个啥,所有就放弃这个方法了
install.packages("devtools")
library("devtools")
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRInstruments.zip')
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRPRESSO.zip')
#前两个很顺利,到TwoSampleMR就不行了
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip')
#还试了
remotes::install_github("mrcieu/ieugwasr")
以及下载安装包安装的,均不行
#报错这个:Timeout was reached: [api.github.com] Resolving timed out after 10000 milliseconds 以及 Could not resolve host: api.github.com
#看了https://www.jianshu.com/p/ca7af7d16bfe ,还是使用下面这个
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)
#出现ERROR,原因是没有一些依赖包,手动安装这些依赖包
#安装TwoSampleMR的依赖包
install.packages("car")
install.packages("glmnet")
install.packages("MendelianRandomization")
install.packages("meta")
install.packages("mr.raps")
install.packages("MRMix")
install.packages("psych")
install.packages("googleAuthR")
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/ieugwasr-master.zip',dependencies = F)
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRMix-master.zip',dependencies = F)
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/RadialMR-master.zip',dependencies = F)
#最后安装TwoSampleMR
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)
出现的报错
安装完依赖包后最后成功
虽然有些问题仍然没有解决,但是如果以后再遇到这种github包安装的时候可以借鉴相同思路。
参考链接:
https://cloud.tencent.com/developer/article/2078517
https://www.jianshu.com/p/ca7af7d16bfe