昨天晚上使用sratools下载sra数据出现报错,之前一直能够顺利下载,检查网络连接后也没能解决
报错如下:
于是通过网页下载了
但是在将sra数据转成fastq数据的过程又出现问题
奇怪的是加了后缀.sra后可以顺利转,但是之前没有遇到过,觉得不大确定这个数据是否是对的,还是想知道为什么下载不正常,通过搜索发现别人是通过更新sratools包解决的
https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/643
果然,重新下载sratools包后得以解决这个问题,虽然这个报是六个月前更新的
whatever,总算解决。
https://anaconda.org/bioconda/sra-tools
希望对遇到相同问题的童鞋有帮助