Kaplan-Meier

最新推荐文章于 2024-06-11 19:37:47 发布
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分类专栏： 生信 文章标签： 健康医疗
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Kaplan-Meier 算法

Kaplan-Meier，是一种生存分析的常用方法，用于研究某一个因素对于生存时间的影响。在医学广泛使用，比如新药物是否有效的增加癌症病人的存活时间。
计算方法：假设我们已经计算出了时间t1的生存概率是0.95，我们想要计算活过时间t2的生存概率，那么这个个体必须首先存活过时间1，再从时间t1存活到t2，也就是用0.95*（1-1/19），下面都是一样计算的，注意一下77是删失数据。

案例

下面以一个真实的研究案例来展示K-M法的详细计算过程，数据集为传统癌症药物的疗效情况（新药物略）。数字代表患者生存的天数，号代表数据删失。
患者生存天数：1、2、3、5、6、7、8、9、10、11、24、28、33、49、58、62、65、77、84、104
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捡月亮的小男孩
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生存分析绘图——Kaplan-Meier生存曲线
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人工智能在【多模态:多组学+复发转移+肿瘤起源】的最新研究进展｜顶刊速递·2024-06-11
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Topic 2. 生存分析之 Kaplan-Meier
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关于生存分析，这个大家都非常熟悉，也是临床研究的最最常用的方法，但是在使用过程中，无论是医生还是分析人员对它都有点迷糊，下面我整理的最全的关于生存分析方法的方方面面的知识点，并结合实际的TCGA数据库结果来展示用法，希望能够帮助大家理解其使用的方法和技巧。
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03-17
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绘制生存函数的 Kaplan-Meier 估计生存时间是测量从定义的起始点到给定事件发生的随访时间的数据，例如从缓解期开始到结束的时间或从疾病诊断到死亡的时间。 通常不能应用标准的统计技术，因为基础分布很少是正态...
【Bioinfo Blog 012】【R Code 010】——生存分析(Kaplan-Meier & Cox)
10’s Blog
12-21 1727
来看生存分析~
KMWin:适用于Windows的Kaplan-Meier-开源
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KMWin（适用于Windows的Kaplan-Meier）是一种方便的工具，可用于以图形方式表示Kaplan-Meier生存时间分析的结果。 该程序基于统计软件环境R，并提供易于使用的图形界面。 作为简介，请参见...
一文掌握Kaplan Meier生存分析
m0_37228052的博客
07-02 3339
Kaplan Meier，是一种单因素生存分析。它可用于研究1个因素对于生存时间的影响，在医疗领域中使用广泛。 一、案例说明 当前某研究人员拟观察一种新型癌症药物的疗效情况，首先将100名癌症患者随机分成两组，对照组使用传统治疗方式，实验组使用新式药物治疗方式。并且随访时间为2年。并且以‘是否死亡’为作为结局。希望通过研究了解到新式药物是否对于生存时间带来影响。 药物组别：0代表传统治疗组；1代表新药组。 生存状态：0代表存活或失访，1代表死亡。 生存时间：定量数据。 二、操作步骤 将数据
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12-04 2261
生存分析有个难点是删失(cersored)数据处理，删失数据是指整个数据收集过程都没发生事件的数据。说的有点拗口，举例说我们做某癌症生存分析，那么事件就是因此癌症导致病人死亡。如果有个病人随访期间不幸被车撞死了，那么这个病人记录到此为止，但是我们的事件并没有发生；或者病人突然搬到国外去了，无法继续随访记录，那这个人数据收集结束了，但事件也没有发生。这例子是右删失数据，还有左删失等感兴趣朋友可自行了...
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0. 简介生存分析（survival analysis）是生物医学研究中常用的分析方法。在队列随访研究中，我们会事先定义一些观察终点，比如肿瘤复发、患者死亡、血压达标等，这些终点称为事件（event）。从研究开始到发生事件的时间间隔称为生存时间（survival time），某些场景下也称为失效时间（failure time）。由于生存时间数据具有以下两个特点，所以提出生存分析这一特殊的分析方法：（1）偏态分布：生存时间通常具有明显的偏态分布，有正态分布假设的统计方法不能适用。（2）删失（censoring
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我们首先看看什么是生存分析？因为无法在短时间内评价慢性病患者的预后，所以通常情况下不会简单地采用治愈率、病死率等指标，而是对患者进行随访，分析一定的时间之后患者生存或死亡的情况，这种将事件...
生存分析原理简明教程 单因素生存分析 Kaplan-Meier、LogRank 只能针对单一的变量进行 多因素cox回归分析
生信小博士的博客
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这些具体事件可以是死亡，也可以是肿瘤转移、复发、病人出院、重新入院等任何可以明确识别的事件，而不同条件即为不同的分组依据，可以是年龄、性别、地域、某个基因表达量的高低、某个突变的携带与否等等。下图是钟南山院士在对欧洲呼吸学会针对 Covid-19 的报告中提到的研究结果，他们对湖北省内和省外的病人从开始症状到入院时间做了分析，从发生症状开始，入院则是我们刚才讲的 event 事件，而湖北省内外则是不同的分组条件。图中还提到，
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05-24 1660
其利用生存曲线图，从纵轴生存率为50%处画一条与横轴平行的线，并与生存曲线相交，然后自交点画垂线与横轴相交，此交点对应的时间即为中位生存时间，图解法比较简单直观，但结果比较粗略。在R中，survival包中有很多函数可以对生存数据进行建模，可以使用survfit()函数来估计删失数据的生存曲线，使用coxph()函数用来拟合Cox比例风险模型。生存分析研究的是某个事件发生之前过去的时间，在临床研究中最常见的应用就是死亡率的估计(预测患者的生存时间)，不过生存分析也可以应用于其他领域如机械故障时间等。
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09-11 9770
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R语言Kaplan-Meier生存曲线
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在R语言中，可以使用survminer包中的plot()函数和ggsurvplot()函数来绘制Kaplan-Meier生存曲线。具体步骤如下： 1.首先，需要安装并加载survminer包和survival包，可以使用以下命令： ```R install.packages("survminer") library(survminer) library(survival) ``` 2.接下来，需要准备生存数据，例如使用survival包中的lung数据集： ```R data(lung) ``` 3.然后，使用survfit()函数来估计删失数据的生存曲线： ```R fit <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung) ``` 其中，Surv()函数用来创建生存对象，time表示生存时间，status表示是否发生事件，sex表示性别。 4.最后，使用plot()函数或ggsurvplot()函数来绘制生存曲线： 使用plot()函数： ```R plot(fit, xlab = "Time", ylab = "Survival Probability", main = "Kaplan-Meier Survival Curve by Sex") ``` 使用ggsurvplot()函数： ```R ggsurvplot(fit, data = lung, risk.table = TRUE, pval = TRUE, conf.int = TRUE) ``` 其中，data表示数据集，risk.table表示是否显示风险表格，pval表示是否显示p值，conf.int表示是否显示置信区间。
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