成功案例(IF=7.3)| mNGS揭示肺移植受者气道分泌物的微生物特征

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研究背景

虽然第一例人类肺移植是在1963年进行的,但直到20世纪80年代中期,在克服了大多数手术和药理学挑战之后,该手术才成为治疗终末期肺部疾病的临床现实。然而,发病率和死亡率仍然很高,肺移植受者的生存率低于其他实体器官移植受者,5年生存率为55.6%。对于肺移植受者来说,感染是一个重要的并发症。它是第一年内最常见的死亡原因,与肺部感染相关的呼吸衰竭是术后入院期间死亡的主要原因。因此,术后病因学研究对于肺移植受者在第一年内的感染预防至关重要。本研究采用mNGS结合微生物培养,揭示肺移植受者一周(超早)和一个月(早期)的病因特征。

研究思路

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图一 技术路线

研究结论

本研究通过mNGS技术和微生物培养完成病原学鉴定,发现在38例气道分泌物标本中mNGS的检出率明显高于微生物培养物(P<0.0001)。mNGS鉴定出143种病原微生物;其中细菌性病原体占一半以上(72.73%),革兰氏阳性和阴性菌占比例较大。真菌,如念珠菌,也经常被检测到。微生物培养鉴定的5种(50%)微生物具有多重耐药性(MDR)。在1个月内,26例(68.42%)患者被感染(中位时间为9天),其中10例(38.46%)患者在一周内被感染。在感染者中,9例(34.62%)通过mNGS提前发现病原体,其中大部分在一周内感染(超早)感染。在一周后发生的感染中,mNGS结果与病原之间的一致性有所降低。总体而言,mNGS技术在发现多种微生物菌种方面表现良好,可作为传统病原学检测方法的有效补充手段。

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图2 气道分泌物中mNGS和传统培养检测到的病原体谱

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