- 每次使用前都需要配置环境变量
- export FREESURFER_HOME=$Computer/usr/local/freesurfer #freesurfer文件夹位置
- export SUBJECT_DIR=$Computer/usr/local/recon #recon预处理文件所在位置 ?
- source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh #相当于python中的active-激活
- recon-all -s /user/local/reconresult1 -i /usr/local/T1.nii -all -qcache -parallel
- recon-all
- -s(subjects-文件放置位置) /user/local/reconresult1
- -i(inport-待处理数据文件夹) /usr/local/T1.nii
- -all(走完全部步骤)
- -qcache(按照给定的标准空间/标准脑空间进行预处理) -parallel(左脑和右脑并行处理-减少时间)
- 分两步处理
freeesurfer---recon_all--重建
于 2022-05-27 03:14:58 首次发布