多个单张IMA转一个nii

前言
在使用私有的数据集进行深度学习工作时,往往需要对dicom数据序列进行预处理。由于dicom文件格式的多样性,在原始的数据下进行诸如查看和打标签的工作变得困难。
本文将介绍如何使用dcm2niix这个工具进行dicom到nii.gz格式的转换。

测试环境:Windows10 + python3

工具准备
可以直接下载工具包,选择相应的系统版本即可:
https://github.com/rordenlab/dcm2niix/releases
也可以使用MRIcroGL 中集成的dcm2niix工具,两者都是一样的:
https://github.com/rordenlab/MRIcroGL12/releases

本人机器安装了MRIcroGL,dcm2niix.exe默认安装在C:\Program Files (x86)\MRIcroGL\Resources

这是一个命令行工具,没有GUI,需要添加环境变量,在用户变量和系统变量中同时添加名为dcm2niix的环境变量,在path路径也添加该目录:

打开powershell或者cmd,输入dcm2niix,如果出现以下界面,则环境变量添加成功:

使用

设定好路径名字,拉进去就行

 


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版权声明:本文为CSDN博主「Alpha收割机」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
原文链接:https://blog.csdn.net/u014776464/article/details/106056942

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