Dicom文件(.IMA)批量转化为NIFTI(.nii)文件

@toc

动机

因为NIFTI的文件是三维的图像,而DICOM的文件为二维的多张图像,所以相对于DICOM文件,NIFTI文件训练的张数更少、更加易用于机器学习。

文件概况

我的文件大概是图中的样子,在xuezhong文件夹中有一些子文件夹,……,储存着一些.IMA文件(.IMA文件其实就是Dicom文件的一种,可以直接按照Dicom文件进行操作)。

在这里插入图片描述

步骤

  1. 第一步:我们首先要获取存储影像图片的所有文件夹的路径;
  2. 第二步:将文件夹内的影像转化为.nii格式.

具体操作

第一步

我们首先利用os.listdir()、os.walk()获取文件夹和文件名:

# 第一步:当前目录下所有文件夹下的文件名(不带后缀)
import os

# 利用os.listdir()、os.walk()获取文件夹和文件名
def GetFileName(fileDir):
    list_name = []
    for dir in os.listdir(fileDir):  # 获取当前目录下所有文件夹和文件(不带后缀)的名称
        filePath = os.path.join(fileDir, dir)  # 得到文件夹和文件的完整路径
        # print(filePath)
        if os.</
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