影像组学特征提取工具

最新推荐文章于 2024-05-09 22:28:26 发布
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分类专栏： 医工所 文章标签： 人工智能 python 机器学习
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Mario cai
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专栏目录
影像组学特征提取软件IBEX
03-24
影像组学特征提取软件IBEX，包含了许多 分析模块，如图像导入、勾画、预处理和特 征提取。包含了一阶、二阶和高阶的特征提取算法， 已成功应用于不同模态影像的特征提取，涵盖了CT、 PET和MRI，涉及肺癌、食管癌、头颈癌和脑转移瘤 等
影像组学工具包
01-29
影像组学是医学影像处理领域针对实体肿瘤分析提出的新的方法，科研正热，看标题自然清楚，影像组学工具包Radiomics
Pyradiomics 影像组学 手动特征提取
最新发布
m0_74838875的博客
05-09 1819
我使用的是绝对路径，注意路径中不要出现中文,注意转义字符“/”，原来的路径在这个文件夹里面读取数据。
图像特征提取_影像组学特征提取——知行合一（工具篇）
weixin_39897687的博客
12-18 8181
在上一篇"理论篇"中，咱们一起讨论了保证影像组学特征提取的可重复一致性，所需要具备的各项理论知识，包括实现过程中需要注意的重要细节和避免的错误。但大家心中是否始终存有一个疑问：理论我是清楚了，但真的要我自己动手去编程实现吗？我的目标是完成毕业论文或者发表学术论文，特征提取只是其中一步，真的没时间(没实力)去实现这一大套啊。重复造轮子的事情当然不能干。不用担心，Radiomics的大神们也...
【影像组学】用3Dslicer或Python提取影像组学特征
abdslfwoeugp
06-15 1万+
用3Dslicer或Python提取影像组学特征
Slicer安装包（用于放射组学特征提取等）
09-29
Slicer是一款常用于MR等临床数据分析的工具，可以在内部配置python程序，如常用于放射组学提取特征的pyradiomics。
基于人工智能和大数据的医疗影像组学应用.pptx
10-24
医疗影像组学是这一领域的关键研究内容，它结合了医学影像、基因信息和临床大数据，通过人工智能模型进行高通量的特征提取和分析，以实现精准的疾病诊断和治疗。 传统医疗主要依赖于医生的经验和专业知识，而智能...
基于机器学习的大脑白质影像组学标签识别帕金森病早期阶段的应用研究.pdf
09-24
在训练集的基线MRI中，切割出三维大脑白质以提取每例患者的影像组学特征，进行降维后使用机器学习方法构建影像组学标签。 本研究的主要贡献是开发了一种基于机器学习的大脑白质影像组学标签，以预测帕金森病的早期...
CT 影像组学对原发性胃淋巴瘤与Borrmann IV 型胃癌的鉴别诊断价值.pdf
02-13
CT影像组学是一种新兴的医学图像分析方法，它通过量化和分析CT图像中的大量信息，提取出具有鉴别疾病潜力的特征。 在研究过程中，研究人员回顾性分析了2009年1月至2017年4月间71例患者的数据，这些患者在中南大学...
Li‘s 影像组学radiomics视频学习笔记(41)-如何使用软件提取组学特征
weixin_38594676的博客
03-17 1018
作者：北欧森林 链接：https://www.jianshu.com/p/72186eb3e395 来源：简书，已获授权转载 本笔记来源于B站Up主: 有Li 的影像组学系列教学视频 本节(41)主要内容：影像组学特征提取软件使用介绍 　 RadiomicsWorld.com “影像组学世界”论坛： 影像组学世界/RadiomicsWorld 李博士介绍自己写的一款影像组学特征提取软件featureExtraction_beta1p1的使用。 目前该软件只开发了windows版本。 1、下载、启动软件.
影像组学特征值自动提取及统计软件需求分析
Coder_LCB的博客
10-27 591
Hi There, 由于接收到很多朋友的私信，基本都是需要提取特征值并统计。 因为有这个需求，计划开发这样一个软件，如果可能，请大家留下自己的具体期望：需要什么样的功能？谢谢。 ...
影像组学ibex_Radcloud | OMG，这个影像组学平台超好用！
weixin_39636253的博客
12-21 1666
原标题：Radcloud | OMG，这个影像组学平台超好用！挑战随着医学信息化的不断深入，医疗行业表现出数据输入量和数据积累量的爆发式增长，在复杂的医疗数据中超过80%来自医学影像数据。以往这些数据只能由医生人工分析，但因没有充足的科研时间或缺乏专业数据库处理能力，导致医疗数据的巨大浪费和沉睡。突破面对医疗大数据赋能临床难题，汇医慧影以深耕影像领域的科研积累和始终领先行业的创新技术实力，自主研发...
影像组学 - pyradiomics库 - 入门1
qq_52589927的博客
07-06 4376
通过影像组学的分析，可以从医学影像中挖掘潜在的生物学特征、疾病的影像标志物，并且可以为个体化治疗和疾病管理提供更多信息。它的目标是通过提取和分析医学影像中的大量图像特征，以揭示潜在的生物学特征、疾病信息和治疗预测。可以选择感兴趣的区域进行分割，然后提取各种数学、几何和统计特征。建模和分析：利用选定的特征进行建模和分析，可以使用机器学习、统计学方法等来构建预测模型，发现生物学模式、进行疾病诊断、预后评估等。结果解释和应用：根据特征分析的结果，解释特征与疾病之间的关系，为临床决策、治疗规划和疾病管理提供支持。
「影像组学-特征提取」Mac端 Windows端安装的pyradiomics方法
qq_39231717的博客
08-30 1392
确保计算机已经安装python，并且版本在2.7或者3.4以上 安装步骤 1.打开cmd 2.输入 git clone git://github.com/Radiomics/pyradiomics 3.输入 cd pyradiomics 4.输入 python -m pip install -r requirements.txt 5.输入 python setup.py install 6.打开python，import radiomics，如果没有报错，则表示安装成功 如果报错，试一下...
pyradiomics使用——1. 医学影像的组学特征值（Radiomics Features）提取
Castlehe的博客
05-30 5424
文章目录1. 使用插件1.1 插件安装1.2 插件使用2. 使用python代码2.1 安装2.2 使用2.2.1 官方示例2.2.2 快速使用2.2.3 其它使用3. 组学特征字段意义说明 Github地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics 官方文档地址：https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/features.html 1. 使用插件 从pyradiomics的Github仓库中可以知道，pyradio
【影像组学pyradiomics教程】（三）自定义特征提取
JianJuly的博客
05-07 1万+
本系列博客后续将更新于个人微信公众号，欢迎关注。 3.1 Types of Customization 个性化特征抽取的方法有三种： 指定哪种图像类别（原始图像/衍生图像）用于提取特征； 指定抽取哪种特征（特征类别）； 指定设置。设置可以用于进行预处理，定制特定的滤波器（对图像进行滤波）和特征类别 提示： 在对特征提取器和某个特征类别进行初始化的时候，我们可以使用关键字...
【影像组学pyradiomics教程】（四） pyradiomics模块--Feature Extractor（特征抽取器）
JianJuly的博客
05-07 1万+
本系列博客后续将更新于个人微信公众号，欢迎关注。     4.1 Feature Extractor class radiomics.featureextractor.RadiomicsFeaturesExtractor(*args, **kwargs) 特征抽取器是一个封装的类，用于计算影像组学特征。大量设置可用于个性化特征抽取，包括：需要抽取的特征类别及其对应特征；需要使用的...
【影像组学pyradiomics教程】 （二） pyradiomics 使用示例
热门推荐
JianJuly的博客
05-07 2万+
本系列博客后续将更新于个人微信公众号，欢迎关注。 测试用的图片： pyradiomics\data\brain1_image.nrrd 和 pyradiomics\data\brain1_label.nrrd’ 测试用的配置文件： pyradiomics\examples\exampleSettings\Params.yaml 测试文...
影像组学形态学特征可视化
09-26
### 回答1： 影像组学形态学特征可视化是一种通过可视化技术将医学影像数据中的形态学特征呈现出来的方法。这种方法可以帮助医生更加直观地理解病变的形态学特征，从而提高对疾病的诊断准确性和治疗效果。 常用的影像组学形态学特征可视化方法包括： 1. 体表投影法：将三维影像数据投影到二维平面上，以便医生更加直观地理解病变的位置和形态。 2. 三维重建法：将医学影像数据中的二维切片合成为三维模型，以便医生更加直观地观察病变的形态。 3. 形态学分析法：通过对医学影像数据中的形态学特征进行分析，提取出病变的特征形态，并进行可视化展示，以便医生更加直观地了解病变的形态学特征。 以上这些方法都可以帮助医生更加直观地理解病变的形态学特征，但需要注意的是，这些方法都只是辅助诊断工具，最终的诊断仍需要由医生根据临床症状、影像学表现等多方面综合判断。 ### 回答2： 影像组学形态学特征可视化是指通过使用各种图像处理和分析技术，将影像组学领域中的形态学特征呈现为可视化结果的过程。 影像组学是一种研究组织或器官级别的疾病变化的方法，通过获取医学影像数据（如X射线、磁共振成像等），可以获得关于患者的大量信息。形态学特征是指影像数据中反映组织、器官形态或结构变化的特征，如形状、大小、密度等。通过对这些特征的分析和可视化，可以帮助医生诊断疾病、监测疾病进展、评估治疗效果等。 在影像组学形态学特征可视化过程中，首先需要对原始影像数据进行预处理，例如图像去噪、增强、分割等。然后，根据研究目的和特征选择的需求，从预处理后的数据中提取出形态学特征。这些特征可以是定量的，比如提取器官的大小、形状参数，也可以是定性的，比如提取某个区域的纹理、灰度等特征。 接下来，将提取出的特征进行可视化处理，将其呈现在图像上。可视化方法包括了各种图像处理技术，如绘制等高线、三维重构、颜色映射等。通过将特征可视化在影像上，可以直观地观察和分析疾病的变化趋势，从而更好地理解影像数据，辅助医生判断和做出决策。 总之，影像组学形态学特征可视化是将医学影像中的形态学特征以可视化形式呈现的过程，可以提供对疾病变化的直观观察和分析，对临床医生进行个性化治疗和定量分析具有重要意义。 ### 回答3： 影像组学形态学特征可视化是指通过将医学影像数据进行分析和提取形态学特征，并通过各种可视化技术将这些特征以直观的方式展示出来。 在影像组学中，形态学特征是指从医学影像中提取出来的与疾病相关的形态学特征，例如肿瘤的大小、形状、分布等。这些特征对于疾病的诊断和治疗具有重要意义。 而可视化技术则是将这些形态学特征以可视化的方式展示出来，使医生和研究人员能够更直观地理解和分析影像数据。 常用的可视化技术包括： 1. 二维投影可视化：将三维医学影像数据投影到二维平面上，通过不同颜色和纹理来表示不同的形态学特征，以便于医生观察和分析。 2. 三维体绘制：通过使用体绘制技术将医学影像数据以三维方式呈现，使医生能够更全面地了解病灶的形态和分布。 3. 表面重建：将医学影像数据中的体素（三维像素）重构成三维物体的表面模型，以便于医生更深入地分析病灶的形态和各个表面特征。 4. 动态可视化：通过时间序列的方式展示医学影像数据，观察病灶在时间上的变化，以评估疾病的演变情况。 通过这些可视化技术，医生和研究人员可以更加直观地观察和分析影像组学中的形态学特征，为疾病的诊断和治疗提供更准确的依据。

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