Workbench Command——cifti格式操作

已于 2024-07-05 15:50:54 修改
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分类专栏： FreeSurfer学习 脑网络的图论分析 文章标签： 开发语言 脑功能分区 核磁共振成像
于 2022-10-10 16:06:19 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/xj4math/article/details/127246137
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本文介绍如何使用Workbench创建自定义colorbar，通过制作fun.gii文件、label文本文件，然后生成label.gii文件。以Glasser360模板为例，详细讲解了3个步骤，包括核心命令的使用、文件格式要求和最终效果展示。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在可视化过程中，经常遇到Workbench自带的颜色不满足自己的需求，需要自定义自己的colorbar, 解决办法是制作一个新的label.gii文件即可解决。

Workbench Command——cifti格式操作，如何制作label

效果如下图所示
在这里插入图片描述
下面用经典的Glasser360模板进行举例，Q1-Q6_RelatedValidation210.CorticalAreas_dil_Final_Final_Areas_Group_Colors.32k_fs_LR.dlabel.nii
效果如下所示：
在这里插入图片描述
那怎么实现呢？下面分为3个步骤进行实现

核心命令

wb_command -metric-label-import

具体的使用说明如下：

IMPORT A GIFTI LABEL FILE FROM A METRIC FILE
   wb_command -metric-label-import
      <input> - the input metric file
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从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
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总的来说，做完DPABISurf，就会生成一堆文件夹， 然后开始做统计。 做统计需要选择ResultsS下的文件，S是平滑，这样更容易出结果，smooth kernel是[6 6 6]。 选择ResutlsS -》 AnatSurfLH -》Thickness -》 fsaverage下的XXthickness.gii文件，进行皮层厚度的对比。 AnatSurf是结构像皮层，fsaverage是结构像皮层空间的标准坐标，而功能空间就需要fsaverage5这个标准坐标。 也可以选择ResultsS -》
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