手把手教你使用R语言对数据进行多重插补后回归分析

我们在临床做回顾性研究分析中经常要面对数据缺失的问题,如果数据缺失量大就会对我们的研究结果产生影响,近年来,对数据进行多重插补广泛应用于SCI论文中。我们在之前的文章中已经演示了使用SPSS对数据进行多重插补并分析。今天,我们通过使用R语言的Mice包来演示多重插补并对数据进行分析。
我们使用R语言survival包自带的mgus数据集来进行演示
先把数据导入
library(survival)
library(rms)
data(package=“survival”)
data(“mgus”)
head(mgus)
bc<-mgus
在这里插入图片描述
查看数据,发现存在许多缺失值
在这里插入图片描述
导入mice包,对缺失值进行分析
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
表和图是一样的,表示完全没有缺失的有46个,pcdx pctime 这两个有缺失的有130个,creat缺失的有8个
使用mice进行插补并查看数据,我们可以看到原来缺失的地方已经被插补了数据
imp<-mice(bc)
complete(imp)
在这里插入图片描述
查看一下数据插补的情况,蓝色是原始数据,红色是插补数据,可以看到,比较重合,说明插补得很好
stripplot(imp,pch=19,cex=1.2,alpha=.3)
在这里插入图片描述
最后进行回归分析,很多人不懂怎么使用插补后的数据,其实都是一样进行回归
fit<-with(imp,glm(death~age+sex+dxyr+pcdx,family = binomial))
这里生成了5套回归数据
Fit
在这里插入图片描述
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最后把5套数据的统计值合并就可以了
fit1<-pool(fit)
summary(fit1)
得出最终结果就可以进行分析了
在这里插入图片描述
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### 回答1: R语言中有很多包可以用来做缺失数据多重插补,例如:Amelia, mice, Hmisc 等。 Amelia包可以快速处理大量缺失数据,并支持多种多重插补方法。 mice包提供了许多多重插补方法,并且可以自动处理高维数据。 Hmisc包含了许多数据处理函数,其中也包括多重插补。 选择使用哪个包,取决于数据的大小和复杂度,以及您对多重插补方法的要求。建议先尝试Amelia和mice,如果不满足需求再试试其他包。 ### 回答2: R语言提供了多种方法用于处理缺失数据,并进行多重插补。 首先,可以使用mice(Multivariate Imputation by Chained Equations)包来进行多重插补。mice包通过使用多种变量间的关系,通过多个模型的迭代过程来估计缺失值。这个过程通常包括创建一个线性回归模型,并通过反复迭代的方式对缺失值进行填充。 其次,可以使用missForest包进行多重插补。missForest包使用随机森林方法来估计缺失值。它会通过对每个缺失值进行预测,然后根据其他变量的信息对缺失值进行调整。 另外,可以使用Amelia包进行多重插补。Amelia包使用期望最大化算法来估计缺失值。它通过创建多个数据集副本,并在每个副本中填充不同的缺失值来进行插补。 此外,还可以使用regression方法进行多重插补。这种方法是通过使用线性回归模型来估计缺失值。它通常需要在缺失值之前和之后的观测值之间存在线性关系。 无论选择哪种方法,进行多重插补的步骤通常包括:识别缺失值、选择适当的插补方法、建立模型进行插补、评估插补的质量,并在需要的情况下重复以上步骤。 总的来说,R语言提供了多种方法用于处理缺失数据多重插补,研究人员可以根据自己的数据特点和需求选择合适的方法进行插补。 ### 回答3: R语言提供了多种方法来处理缺失数据多重插补。以下是一种常用的插补方法的步骤: 首先,我们需要加载适当的R软件包,例如`mice`或`Amelia`。 ```R library(mice) ``` 然后,我们需要导入包含缺失数据数据集。 接下来,我们可以使用以下代码创建一个多重插补模型: ```R imp_model <- mice(data, m = 5, meth = 'pmm', seed = 123) ``` 其中,参数`data`是包含缺失数据数据集,`m`是要执行的多重插补数量,`meth`是用于插补的方法,`seed`是用于随机数生成器的种子。 然后,我们可以查看多重插补后的数据: ```R imputed_data <- complete(imp_model) ``` 这将返回包含了插补值的数据集。 我们还可以使用以下代码来查看插补情况的可视化图表: ```R plot(imp_model) ``` 这将显示每个变量的缺失数据情况、插补的趋势等信息。 最后,我们可以使用插补后的数据进行进一步的统计分析或建模。 总结来说,R语言提供了易于使用多重插补方法,可以帮助我们处理缺失数据,并提供了相关的可视化工具来评估插补效果。

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