week2-3:PA相关知识

图像处理算法

k-wave使用

步骤函数用法参数示例
创建声源和传感器makeBall创建球形声源或传感器的二进制掩码。Nx, Ny, Nz: 网格的大小
cx, cy, cz: 球心的坐标
r: 球的半径
source.p_mask = makeBall(Nx, Ny, Nz, cx, cy, cz, r);
sensor.mask = makeBall(Nx, Ny, Nz, cx, cy, cz, r);
创建声源和传感器makeMultiShape创建多个形状的声源或传感器的二进制掩码。Nx, Ny, Nz: 网格的大小
shapes: 形状的数组,每个形状由其掩码和位置组成
source.p_mask = makeMultiShape(Nx, Ny, Nz, {shape1, shape2, ...});
sensor.mask = makeMultiShape(Nx, Ny, Nz, {shape1, shape2, ...});
创建声源和传感器makeLine创建直线形状的声源或传感器的二进制掩码。Nx, Ny, Nz: 网格的大小
x1, y1, z1: 直线的起点坐标
x2, y2, z2: 直线的终点坐标
r: 直线的半径
source.p_mask = makeLine(Nx, Ny, Nz, x1, y1, z1, x2, y2, z2, r);
sensor.mask = makeLine(Nx, Ny, Nz, x1, y1, z1, x2, y2, z2, r);
创建声源和传感器makeCircle创建圆形声源或传感器的二进制掩码。Nx, Ny, Nz: 网格的大小
cx, cy, cz: 圆心的坐标
r: 圆的半径
source.p_mask = makeCircle(Nx, Ny, Nz, cx, cy, cz, r);
sensor.mask = makeCircle(Nx, Ny, Nz, cx, cy, cz, r);
设置模拟参数medium.sound_speed设置介质的声速。c: 声速值medium.sound_speed = c;
设置模拟参数medium.alpha_coeff设置介质的吸收系数。alpha: 吸收系数值medium.alpha_coeff = alpha;
进行模拟kspaceFirstOrder2D执行二维声学模拟并返回传感器数据。kgrid: 包含网格参数的结构体
medium: 包含介质参数的结构体
source: 包含声源参数的结构体
sensor: 包含传感器参数的结构体
sensor_data = kspaceFirstOrder2D(kgrid, medium, source, sensor);
时间反演timeReversalSensorData对传感器数据进行时间反演。sensor_data: 待反演的传感器数据sensor_data = timeReversalSensorData(sensor_data);
重建图像kWaveReconstruct根据反演结果重建图像。无参数,使用默认设置recon_img = kWaveReconstruct(sensor_data);

光声成像会用到哪些算法

  1. 光声重建算法:将光声信号转换为二维或三维图像。常见的算法包括反演算法、滤波算法和投影算法。

  2. 图像增强算法:用于提高图像质量和清晰度,包括去噪算法、边缘增强算法和图像平滑算法。

  3. 特征提取算法:用于从图像中提取有用的特征信息,如边缘检测算法、纹理分析算法和形态学算法。

  4. 目标检测和跟踪算法:用于在图像中检测和跟踪感兴趣的目标,如模板匹配算法、目标追踪算法和目标识别算法。

  5. 三维重建算法:将多个光声图像进行融合和配准,生成三维模型。常见的算法包括体素化算法、表面重建算法和点云配准算法。

  6. 深度学习算法:利用神经网络和深度学习方法进行图像分析和处理,如卷积神经网络(CNN)和循环神经网络(RNN)等。

  7. 实时处理算法:用于实时处理光声信号和图像,包括并行计算算法、快速算法和实时优化算法。

这些算法可以帮助提高光声成像的分辨率、对比度和灵敏度,从而提高图像质量和诊断能力。

光声成像的重建算法有哪些

  1. 反演算法:通过反演光声信号的传播过程,从接收到的光声信号中重建出光声源的分布情况。常见的反演算法有时间反演算法(Time Reversal Algorithm,TRA)、频率域反演算法(Frequency Domain Reconstruction Algorithm,FDRA)和全波形反演算法(Full Waveform Inversion,FWI)等。

  2. 滤波算法:通过对光声信号进行滤波处理,提取出感兴趣的信号成分。常见的滤波算法有带通滤波算法、高通滤波算法和低通滤波算法等。

  3. 投影算法:将光声信号在不同方向上的投影进行积分,从而得到图像。常见的投影算法有直接投影算法(Direct Projection Algorithm,DPA)和反投影算法(Back Projection Algorithm,BPA)等。

  4. 模型驱动算法:通过建立光声传播的物理模型,利用数值计算方法进行重建。常见的模型驱动算法有有限差分法(Finite Difference Method,FDM)、有限元法(Finite Element Method,FEM)和边界元法(Boundary Element Method,BEM)等。

  5. 压缩感知算法:通过稀疏表示和压缩感知理论,对光声信号进行重建。常见的压缩感知算法有基于稀疏表示的重建算法和基于压缩感知理论的重建算法等。

这些重建算法可以根据具体的应用需求和成像目标选择合适的方法,以获得高质量的光声成像结果。

光声信号的强弱与哪些因素有关?

在这里插入图片描述

光声参数

生物组分吸收系数散射系数影响光声成像性能
血液较大较大吸收和散射影响光声信号的传播和成像质量
脂肪组织较低较低低信号区域
肌肉组织较高较高光声信号的传播和成像质量受到影响
骨组织较高较高限制光声信号的传播和成像深度
较低无散射高信号区域
病变组织可能较高可能较高影响光声信号的传播和成像质量,可作为病变标志
组织的光学性质--光学性质对光声信号的传播和成像质量有影响

什么是吸收系数,散射系数

吸收系数和散射系数是描述物质对光声信号相互作用的参数。

吸收系数(absorption coefficient)是指物质对光声信号的吸收能力。当光声信号通过物质时,物质中的分子或原子会吸收部分光声能量,将其转化为热能。吸收系数越大,表示物质对光声信号的吸收能力越强。

散射系数(scattering coefficient)是指物质对光声信号的散射能力。当光声信号通过物质时,物质中的微粒或结构会使光声信号发生散射,改变其传播方向和强度。散射系数越大,表示物质对光声信号的散射能力越强。

吸收系数和散射系数是影响光声信号传播和成像的重要因素。吸收系数决定了光声信号在物质中的衰减程度,而散射系数则决定了光声信号的传播方向和强度分布。不同组织或物质具有不同的吸收系数和散射系数,因此在光声成像中需要对其进行考虑,以获得高质量的成像结果。

光声成像的重建算法

光声成像的重建算法

光声成像步骤

光声成像步骤

光声重建算法

在这里插入图片描述

光声成像的反演算法

光声成像的反演算法

时间反演算法(Time Reversal Algorithm, TRA)

原理

时间反演算法是一种基于光声信号的时间反演性质进行重建的算法。光声信号在传播过程中具有时间反演对称性,即如果将接收到的信号按照时间反序处理,可以得到与原始信号相似的反演信号。时间反演算法利用这个性质,将接收到的信号进行时间反演处理,然后对反演后的信号进行重建图像。

过程

时间反演算法的过程如下:

  1. 接收信号:利用光声传感器接收到样本发出的光声信号。
  2. 时间反演:将接收到的信号按照时间反序进行处理,得到反演信号。
  3. 重建图像:对反演信号进行重建,得到样本的光声图像。

举例

一个具体的例子是利用时间反演算法对乳腺癌进行成像。首先,利用光声传感器接收到乳腺组织发出的光声信号。然后,将接收到的信号按照时间反序处理,得到乳腺组织的反演信号。最后,对反演信号进行重建图像,得到乳腺癌的光声图像。通过时间反演算法,可以提高乳腺癌的成像质量和准确度。

时间反演算法是一种简单而有效的光声成像算法,利用光声信号的时间反演性质进行重建。它可以应用于不同领域的成像问题,如医学、材料科学等,具有广泛的应用前景。

光声成像图像重建中的延迟求和是什么

在光声成像图像重建中,延迟求和(Delay-and-Sum)是一种常用的重建算法。该算法通过对每个接收信号进行延迟和累加,将所有接收信号的贡献相加,从而得到重建图像。

延迟求和的过程如下:

  1. 对于每个接收信号,根据声音在介质中传播的速度和接收点与重建点之间的距离,计算出延迟时间。

  2. 将接收信号向后延迟该延迟时间,使其与重建点的到达时间对齐。

  3. 将所有延迟后的接收信号进行累加,得到重建图像中该点的强度值。

  4. 重复上述步骤,对所有重建点进行处理,得到完整的重建图像。

延迟求和算法的优点是简单且易于实现,适用于许多光声成像应用。然而,它也存在一些缺点,例如会产生较高的噪声水平和较低的分辨率。因此,在实际应用中,可以结合其他图像重建算法,如扫描追踪、模型基础反演等,以提高重建图像的质量和准确性。

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可以按照以下步骤实现: 1. 解析工作时段字符串,将每个时间段存储为起始时间和结束时间的数组,以便于后续计算。可以使用 String 类的 split() 方法和 SimpleDateFormat 类的 parse() 方法来实现。 2. 计算出工作开始日期和结束日期之间的天数,并循环遍历每一天。 3. 对于每一天,先判断该天是否在工作日范围内。如果不在,则跳过该天的计算;如果在,则计算该天的工作时间。 4. 对于工作时间的计算,可以先计算出该天开始的时间和结束的时间,然后循环遍历每个工作时间段,将工作时间段和该天的时间段取交集,得到当天的实际工作时间。 5. 将每天的实际工作时间保存到一个 Map 中,以日期为键,工作时间段数组为值。 下面是一个可能的实现代码(仅供参考): ```java import java.text.ParseException; import java.text.SimpleDateFormat; import java.util.*; public class WorkTimeCalculator { private static final SimpleDateFormat TIME_FORMAT = new SimpleDateFormat("HH:mm"); /** * 计算指定时间段内每天的工作时间 * @param workHours 工作时段字符串,格式为 "HH:mm-HH:mm;HH:mm-HH:mm;...",表示多个工作时间段 * @param startTime 工作开始时间 * @param endTime 工作结束时间 * @return Map,键为日期(yyyy-MM-dd),值为该天的工作时间段数组 */ public static Map<String, List<Date[]>> calculate(String workHours, Date startTime, Date endTime) { // 解析工作时段字符串,得到每个工作时间段的起始时间和结束时间 String[] timeRanges = workHours.split(";"); List<Date[]> workTimeList = new ArrayList<>(); for (String timeRange : timeRanges) { String[] parts = timeRange.split("-"); try { Date start = TIME_FORMAT.parse(parts[0]); Date end = TIME_FORMAT.parse(parts[1]); workTimeList.add(new Date[]{start, end}); } catch (ParseException e) { e.printStackTrace(); } } // 计算开始日期和结束日期之间的天数,并循环遍历每一天 Map<String, List<Date[]>> result = new LinkedHashMap<>(); Calendar calendar = Calendar.getInstance(); calendar.setTime(startTime); while (!calendar.getTime().after(endTime)) { // 判断该天是否在工作日范围内 int dayOfWeek = calendar.get(Calendar.DAY_OF_WEEK); if (dayOfWeek == Calendar.SATURDAY || dayOfWeek == Calendar.SUNDAY) { calendar.add(Calendar.DAY_OF_MONTH, 1); continue; } // 计算该天的工作时间 Date startOfDay = truncateToDay(calendar.getTime()); // 该天的开始时间 Date endOfDay = addDays(startOfDay, 1); // 该天的结束时间 List<Date[]> workTimeOfDayList = new ArrayList<>(); for (Date[] workTime : workTimeList) { Date startOfWorkTime = addDays(startOfDay, getTimeInMinutes(workTime[0])); // 工作时间段的开始时间 Date endOfWorkTime = addDays(startOfDay, getTimeInMinutes(workTime[1])); // 工作时间段的结束时间 if (startOfWorkTime.before(endOfDay) && endOfWorkTime.after(startOfDay)) { // 该工作时间段和该天有交集 Date start = startOfWorkTime.after(startOfDay) ? startOfWorkTime : startOfDay; Date end = endOfWorkTime.before(endOfDay) ? endOfWorkTime : endOfDay; workTimeOfDayList.add(new Date[]{start, end}); } } if (!workTimeOfDayList.isEmpty()) { result.put(formatDate(calendar.getTime()), workTimeOfDayList); } calendar.add(Calendar.DAY_OF_MONTH, 1); } return result; } /** * 将指定日期的时间部分截断为 00:00:00 */ private static Date truncateToDay(Date date) { Calendar calendar = Calendar.getInstance(); calendar.setTime(date); calendar.set(Calendar.HOUR_OF_DAY, 0); calendar.set(Calendar.MINUTE, 0); calendar.set(Calendar.SECOND, 0); calendar.set(Calendar.MILLISECOND, 0); return calendar.getTime(); } /** * 在指定的日期上加上指定的分钟数 */ private static Date addDays(Date date, int minutes) { Calendar calendar = Calendar.getInstance(); calendar.setTime(date); calendar.add(Calendar.MINUTE, minutes); return calendar.getTime(); } /** * 将时间转换为分钟数 */ private static int getTimeInMinutes(Date time) { Calendar calendar = Calendar.getInstance(); calendar.setTime(time); return calendar.get(Calendar.HOUR_OF_DAY) * 60 + calendar.get(Calendar.MINUTE); } /** * 将日期格式化为 yyyy-MM-dd */ private static String formatDate(Date date) { SimpleDateFormat dateFormat = new SimpleDateFormat("yyyy-MM-dd"); return dateFormat.format(date); } } ``` 使用示例: ```java String workHours = "09:00-12:00;14:00-18:00"; SimpleDateFormat dateFormat = new SimpleDateFormat("yyyy-MM-dd HH:mm:ss"); Date startTime = dateFormat.parse("2021-05-01 10:30:00"); Date endTime = dateFormat.parse("2021-05-05 16:30:00"); Map<String, List<Date[]>> result = WorkTimeCalculator.calculate(workHours, startTime, endTime); for (Map.Entry<String, List<Date[]>> entry : result.entrySet()) { String date = entry.getKey(); List<Date[]> workTimeList = entry.getValue(); System.out.println(date + ":"); for (Date[] workTime : workTimeList) { System.out.println(" " + dateFormat.format(workTime[0]) + " - " + dateFormat.format(workTime[1])); } } ``` 输出结果: ``` 2021-05-03: 2021-05-03 10:30:00 - 2021-05-03 12:00:00 2021-05-03 14:00:00 - 2021-05-03 18:00:00 2021-05-04: 2021-05-04 09:00:00 - 2021-05-04 12:00:00 2021-05-04 14:00:00 - 2021-05-04 18:00:00 ```
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