deepmd-kit不同描述子的含义

本文译自描述子官方解释，下图所示：

deepmd-kit内置了多个descriptor，不同的descriptor的机制有微小差异。
下面是论文里的示意图：

DOI: 10.1103/PhysRevLett.120.143001

可以看出模型总体思路是

1. 把每个原子的坐标变成领域坐标
2. 把领域坐标塞进embedding net转化成descriptor，此时的descriptor拥有平移不变性，旋转不变性以及排列组合不变性
3. 再将descriptor塞进深度网络里，得到每个原子上分配的能量，最后汇总得到总能量。

下面这张图详细解释了descriptor的过程：

arXiv:1805.09003v2 [physics.comp-ph] 20 Dec 2018
还有这张

DOI: 10.1103/PhysRevLett.120.143001

更多解释可以看原文。
下面简要介绍各个descriptor
首先se开头的指smooth_edition

$s(r_{ji})$在构建的时候使用了平滑值，e2指构造embedding net 的时候使用了两原子间的信息。
两篇文章的模型有点混乱（可能是我自己看不清），反正第二篇end to end开头的那篇，引入了平滑的机制。我们以下面这张图为准。

可以看出最终的descriptor由两部分组成，一部分是embedding过后的，另一部分是环境矩阵。

se_e2_a

指环境矩阵是4列，包含了距离信息（第一列）和角度信息（2,3,4列），e2指 两 原子间的信息，即距离信息，embedding net的输入信息是环境矩阵的第一列，距离信息。

se_e2_r

指环境矩阵只有一列，距离信息。embedding net的输入就是这一列。

se_e3

指环境矩阵是4列，包含了距离信息（第一列）和角度信息（2,3,4列），e3指 三 原子间的信息，即角度信息，embedding net的输入信息是环境矩阵的第2,3，4列，角度信息。

loc_frame

指在每个原子周围定义一个局域帧，Decriptor就在这个局域帧里进行计算。

hybrid

指将几个descriptor糅合，形成一个新的。