生物信息数据库收集

最新推荐文章于 2024-05-16 23:04:52 发布
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分类专栏： 数据集 文章标签： 数据库
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生物信息数据库（持续更新）

NCBI

NCBI 最大的生物数据网络之一 链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Genome Browser

收集各类基因组范围数据的地方: http://genome.ucsc.edu/

TCGA

比较实用的癌症数据库 https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga

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生物数据集
florashiying的专栏
11-04 385
hHG002​​​​​​​​​​​​​​​​​​​ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/Ultralong_OxfordNanopore/guppy-V3.4.5/ ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/AshkenazimTrio/HG002_NA24385_son/Ultralong_OxfordNanopore/guppy-
生物信息数据库
一只电饭煲的博客
11-17 6846
生物信息与药物数据库前言一、生物信息学二、蛋白质相关数据库1.STRING数据库2.Uniprot数据库3.DIP数据库4.HPRD数据库二、基因相关数据库1.COXPRES db数据库2.Coexpedia数据库3.OMIM数据库三、RNA,ncRNA数据库1.miRNA相关数据库2.ncRNA相关数据库四、通路数据库1.KEGG数据库2.BioCyc数据库3.RegulonDB数据库五、基因表达数据库1.TCGA数据库2.CGGA数据库3.GEO数据库六、疾病与基因关联数据库1.DISNOR数据库2.D
生物信息学数据库_寻找生物数据集来激发您的下一个生物信息学项目
weixin_26745985的博客
09-05 672
生物信息学数据库Bioinformaticians provide irreplaceable expertise across the field of biology. It’s no surprise that universities offer more and more opportunities for students to learn these techniques. Whil...
生物医学数据库
shaodowha的博客
06-22 1278
医学数据库
public-bioinformatics-datasets:用于生物信息学和综合组学研究的公开数据集
06-10
公共生物信息学数据集 用于生物信息学和综合组学研究的公开数据集（进行中） 基因组学 转录组学 → 表观基因组学 临床和医疗保健 iDash 数据存储库（有多个数据集） i2b2 NLP 数据集 医学线 癌症的监测、流行病学和最终结果 (SEER) 模拟II 医疗成本和利用项目 (HCUP) 全国健康和营养检查调查 (NHANES) 全国门诊医疗调查 (NAMCS/NHAMCS) 社区追踪研究 全国健康访谈调查
深度学习数据集—动物数据集大合集（二）
weixin_44906759的博客
05-07 3729
近期又整理了一批各类动物数据集，分享给大家。废话不多说，直接上干货！！
生物信息数据库文库.pptx
09-29
《生物信息数据库文库》是关于生物信息学领域的一个PPT文档资料，主要涉及生物信息中心、生物信息数据库、数据库检索工具以及相关的生物分析软件。本文将深入探讨这些知识点。 一、生命信息学与生物信息中心 生命...
生物信息数据库应用
07-03
依托国家基因库样本库丰富的生物样本资源及深圳华大基因研究院高通量测序平台、高性能计算平台和信息分析能力，收集海量的基因组、转录组、蛋白组、代谢组及临床表型等数据信息，并致力于搭建生物大数据共享和应用...
肿瘤生物信息学数据库.docx
09-22
肿瘤生物信息学数据库的构建涉及到数据的收集、整理、存储、分析和注释等多个步骤。这些数据库通常由多组学数据构成，包括基因表达谱、甲基化谱、体细胞变异等。这些数据来源于各种来源，包括公共数据库、研究论文和...
生物信息神奇网站系列（十二）：机器学习数据集
xxxie_的博客
07-14 557
天天都被媒体的大数据，机器学习，人工智能忽悠，但是常言道“巧妇难为无米之炊”，要实现这些，数据才是重点；有时候想测试一些算法，手头没有现成的测试数据也比较麻烦。不过，加州大学欧文分校提供了一个机器学习的数据集，可以从中下载大量数据，用于机器学习研究。 十二：加州大学欧文分校机器学习数据集 http://archive.ics.uci.edu/ml/index.php 1、登录网站，可以看到“Wel...
organizing_bioinformatics_code_and_projects：组织生物信息学数据，结果和代码的指南
02-05
organizing_bioinformatics_code_and_projects：组织生物信息学数据，结果和代码的指南
生物信息学算法
02-21
欢迎！ 该存储库包含我在Phillip Compeau和Pavel Pevzner撰写的《生物信息学算法：一种主动方法》中算法的许多实现。 已针对rosalind.info（与文本相对应的网站）上的数据集测试了该存储库中的每个文件。
【数据集】数据集总结
qq_41985559的博客
12-03 2385
1.http://snap.stanford.edu/index.html。 2.http://www-personal.umich.edu/~mejn/ 3.http://deim.urv.cat/~aarenas/data/welcome.htm 4.http://www.correlatesofwar.org/ 5.http://www.gmw.rug.nl/~huisman/sna/sof...
常用的医学组织切片细胞图像数据集
new_0428的博客
10-22 1万+
乳腺癌细胞图像数据集、血细胞图像数据集、HE染色切片、疟疾细胞图像 图像识别、分类、分割
【GoogLeNet】海洋生物识别
Kevin Tang的博客
05-20 6760
图像分类是根据图像的语义信息将不同类别图像区分开来，是计算机视觉中重要的基本问题。本实践使用本实践使用卷积神经网络GoogLeNet模型构建深度学习模型，自动提取高质量的特征，来解决海洋鱼类识别的问题。......
深度学习基础知识
最新发布
weixin_43946736的博客
05-16 757
在深度学习中，数据集扮演着至关重要的角色。它们是训练机器学习模型的基础，决定了模型能够学习到的模式和特征。
PPI数据集
ziqingnian的博客
01-22 1万+
PPI（Protein–protein interactions）蛋白质交互作用 下载地址：http://snap.stanford.edu/graphsage/ppi.zip PPI 网络是蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction,PPI）网络的简称，在GCN中主要用于节点分类任务 PPI是指两种或以上的蛋白质结合的过程，通常旨在执行其生化功能。 一般地，如果两个蛋白质共同参与一个生命过程或者协同完成某一功能，都被看作这两个蛋白质之间存在相互作用。多个蛋白质之间的复杂
生物信息学三大数据库NCBI-ENSEMBL-UCSC
热门推荐
watermel__的博客
05-18 3万+
NCBI NCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心）于1988年11月4日建立，是NIH（美国国立卫生研究院）的NLM（国立医学图书馆）的一个分支。目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库，包括：PubMed, PubMed Central, and GenBank等。网址： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
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