**探索单细胞转录组数据的新维度 —— CZ CELLxGENE Annotate**

探索单细胞转录组数据的新维度 —— CZ CELLxGENE Annotate

cellxgene An interactive explorer for single-cell transcriptomics data cellxgene 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ce/cellxgene

项目基础介绍与编程语言

CZ CELLxGENE Annotate,一个为单细胞转录组数据设计的交互式探索工具,旨在通过现代web开发技术实现百万级别细胞数据的快速可视化。该项目由Chan Zuckerberg Initiative发起并维护,支持科研界高效分析来自如人类细胞图谱等项目的复杂数据。核心编程语言包括JavaScript和Python,后者用于后端科学计算和数据分析,前者则构建其互动界面。

核心功能

  • 大规模数据可视化: 支持至少一百万细胞的快速展示。
  • 交互式探索: 用户可以基于基因表达阈值和元数据属性筛选和子集化细胞。
  • 兼容性广泛: 支持多种预处理过的单细胞数据格式。
  • 与社区集成: 整合了与开源社区合作的成果,如与scanpy工具的紧密合作。
  • 易用性: 提供简洁的命令行接口启动应用,以及详尽的文档指导。

最近更新的功能

由于未提供具体的时间节点和详细的更新日志,无法精确指出最近的具体更新内容。但根据一般开源项目惯例,更新可能涵盖以下几个方面:

  • 性能优化: 可能增强了大容量数据加载和渲染速度。
  • 兼容性增强: 更新以支持更多浏览器版本或新数据标准。
  • 用户体验改进: 包括UI调整、用户交互流程简化等。
  • 安全性加强: 可能会修复已知的安全漏洞,并提升整体系统安全。
  • API扩展或修改: 为了增加可扩展性和与其他生物信息学工具的互操作性,可能会有API层面的变化。

请注意,要获取确切的最新更新详情,建议直接访问项目GitHub页面的Release标签页或Changelog文件。

cellxgene An interactive explorer for single-cell transcriptomics data cellxgene 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ce/cellxgene

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