数据分析：手把手教你R语言复现mindfulness_PTSS_COVID19文献结果

生信学习者2

已于 2024-06-30 15:47:12 修改

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分类专栏：数据分析文章标签： r语言数据分析学习

于 2024-06-07 10:30:35 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/H20230717/article/details/139519559

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获取该教程见WX公zhong号：生信学习者（复现文章：手把手教你R语言复现mindfulness_PTSS_COVID19文献结果，提示：收费）。本教程是针对The more mindfulness practice, the more post‐trauma stress symptoms? Trait mindfulness and PTSS during the COVID‐19 pandemic文献的结果复现。

本教程是针对The more mindfulness practice, the more post‐trauma stress symptoms? Trait mindfulness and PTSS during the COVID‐19 pandemic文献的结果复现。

请添加图片描述

该文献的研究点和结论见下面：

这篇文章研究了在COVID-19大流行期间，个体的特质正念（trait mindfulness）、冥想经历以及流行病/疫情经历对创伤后应激症状（PTSS）的影响，以及情绪韧性在其中的中介作用。研究共有522名来自中国湖北省的参与者，他们完成了五因素正念问卷（Five Facet Mindfulness Questionnaire）、青少年情绪韧性问卷（Adolescents’ Emotional Resilience Questionnaire）以及DSM-5的PTSD检查表（PTSD Checklist for DSM-5）。研究结果表明：

有家人或朋友被诊断出COVID-19的参与者在回避行为上的得分更高。
有家人或朋友被诊断出SARS或H1N1的参与者在PTSS总分上的得分更高。
有冥想经历的参与者在PTSS的所有维度上（除了回避）得分显著更高。
特质正念与PTSS之间的关系中，从负面情绪中恢复的能力（recovering from negative emotions）起到了显著的中介作用（95%CI= [-0.212, -0.094]），而产生积极情绪的能力（generating positive emotion）的中介作用不显著（95%CI= [-0.050, 0.071]）。

文章的结论是，具有疫情/流行病经历的个体更有可能表现出更高水平的PTSS。具有冥想经历的个体也表现出更高水平的PTSS，这可能与冥想的质量有关。特质正念以及从负面情绪中恢复的能力是防止PTSS的保护因素。研究强调了在COVID-19大流行期间，提高个体的正念水平和情绪调节能力对于减轻PTSS和促进创伤后适应的重要性，尤其对于那些有先前创伤经历的个体。

文章对上述结论的结果数据分析是使用的SPSS软件，本教程将使用R语言对文章的结果进行整体复现。因为文章没有给出每个维度的规则，所以最后R计算得到的结果会与文章存在部分偏差。

教程

本教程提供了四种不同的格式，HTML、PDF、word和epub，方便广大读者阅读。

在这里插入图片描述

文章结果 {#sec-tables}

文章的结果是由五个表格构成，它们分别是：

Table1: Demographic characteristics of the sample

请添加图片描述

Table2: Analysis of differences in attitudes and PTSS among individuals experiencing different epidemics
Table3: Analysis of differences in all variables among individuals with different gender and meditation experience (n=522)

请添加图片描述

Table4: The mean (M), standard deviation (SD), and Pearson’s correlations of the variables (n = 522)

请添加图片描述

Table5: Analysis of total, direct and indirect effects of trait mindfulness on PTSS

请添加图片描述

教程设置

关于教程：教程安排是这样的，每个章节是对每张表格的R复现。

第1章：数据预处理
第2章：生成表1（Table1: Demographic characteristics of the sample）
第3章：生成表2（Table2: Analysis of differences in attitudes and PTSS among individuals experiencing different epidemics）
第4章：生成表3（Table3: Analysis of differences in all variables among individuals with different gender and meditation experience (n=522)）
第5章：生成表4（Table4: The mean (M), standard deviation (SD), and Pearson’s correlations of the variables (n = 522)）
第6章：生成表5（Table5: Analysis of total, direct and indirect effects of trait mindfulness on PTSS）
第7章：总结

需要的R包 {#sec-package}

需要使用到的R包，大家可以通过install.packages("package_names")安装或其他方式。

xfun::session_info(packages = c(
  "tidyverse", "readxl", "gtsummary", 
  "stringr", "writexl", "psych", 
  "rstatix", "Hmisc", "mediation", 
  "lavaan", "openxlsx", "huxtable", 
  "DT", "kableExtra"
), dependencies = FALSE)

#> R version 4.3.3 (2024-02-29)
#> Platform: aarch64-apple-darwin20 (64-bit)
#> Running under: macOS Sonoma 14.2
#> 
#> Locale: en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8 / C / en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8
#> 
#> Package version:
#>   DT_0.33          gtsummary_1.7.2  Hmisc_5.1.3      huxtable_5.5.6  
#>   kableExtra_1.4.0 lavaan_0.6.17    mediation_4.5.0  openxlsx_4.2.5.2
#>   psych_2.4.3      readxl_1.4.3     rstatix_0.7.2    stringr_1.5.1   
#>   tidyverse_2.0.0  writexl_1.5.0