10X_Genomics_scRNA_Seq 名词解释

Sample(样本):单个生物来源(血液、组织等)提取的细胞混悬液。(标示是index)

Library(文库):从一个样本制备的1个10X-barcoded测序文库,对应着一个10x Chromium Controller run 的单芯片通道。(标示是barcoded)

Flowcell:一个类似载玻片的测序芯片,包含了一个run的测序数据,该数据可根据芯片上的 lane 和 样本的 index 拆分。

lane(通道):通常一张flowcell(芯片)上会有多条lane

一个sample可制备多个library,这样不必重复加10x Chromium Controller run就能获得更多细胞数

一个文库(library)可以被多个芯片(flowcell)测序,然后合并,就像这些read是从一次run获得的

一个芯片(flowcell)可以包含多个文库(library),按照 lane 区分和 index 拆分

一个通道(lane)上可以包含多个文库(library),按照文库(library)的 barcoded 拆分

10X_Genomics 给出的工作流程示例:

 

 

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