R读取包里的自带文件（自备）

场景：某些时候使用R包自带的文件运行，但是相关内容不经过导出有可能无法知道具体文件的内容和格式。所以需要导出进行详细查看。

例如maftools包中的文件

rm(list = ls())
library(maftools)

laml.maf = system.file("extdata", "tcga_laml.maf.gz", package = "maftools")
laml.clin = system.file("extdata", "tcga_laml_annot.tsv", package = "maftools")

laml.clin##查看位置
#[1] "C:/Users/位置.tsv"

##重新读取文件
data <- read.delim("C:/Users/位置.tsv", sep = "\t")

##可以将文件写出
write.csv(data,"data.csv")

这样就可以查看文件细节

突变参考：

新版TCGA突变maf数据下载整合及瀑布图绘制和TMB计算 – 王进的个人网站 (jingege.wang)

DNA 6. 基因组变异之绘制精美瀑布图（ComplexHeatmap）_tcga_laml.maf.gz-CSDN博客