①分析胃癌组蛋白脱乙酰酶HDS模型-配对转录组差异

目录

HDS评分构建

①数据加载

②评分计算

做样本及评分展示图

①数据处理

②进行作图

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分析配对的单细胞及转录组胃癌数据的 HDS评分，数据源于gastric-cancer - GitCode①胃癌单细胞和配对转录组揭示胃肿瘤微环境（文献和数据）_代码笔记:处理迄今为止最大的单细胞胃癌数据集-CSDN博客

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HDS评分构建

评分基因为单因素Cox回归分析中，HR<为1的基因被定义为基因集A，HR>为1的基因被定义为基因集B。A和B基因集用于后续分析。采用PCA构建HDS，其中主成分1被选为特征评分。

geneA1
 [1] "TRAF7"    "RPS6"     "NDOR1"    "CC2D1A"   "SERINC2"  "ESCO2"    "ZBTB7B"  
 [8] "NOP16"    "SPC24"    "USP5"     "AK2"      "CHAF1A"   "MCCC2"    "GEMIN4"  
[15] "TNK1"     "EARS2"    "PA2G4"    "HNRNPAB"  "GNAI3"    "UBE2D1"   "RNF126"  
[22] "SLC30A5"  "MYRF"     "PSME3"    "TUFM"     "YAF2"     "HMBS"     "SEMA4G"  
[29] "PCNXL3"   "DNAJA1"   "USP38"    "RCC1"     "SENP1"    "GSS"      "RASSF7"  
[36] "L