从零开始用docker做新冠病毒基因组数据质检

首先从NCBI上,随便下载一个新冠病毒基因组原始数据:SRR18893768.fastq
在这里插入图片描述

在这里插入图片描述
用filezilla将这个文件上传到linux系统的云服务器。
在这里插入图片描述

安装docker
dockerhub中搜索“fastqc”,复制页面右边的Docker Pull Command
在这里插入图片描述
在服务器中输入

docker pull staphb/fastqc#下载fastqc镜像

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docker images
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