新冠知识图谱学习记录

新冠知识图谱构建与问题记录

项目地址

开始前的安装工作

1. pycharml连接github
   login登录报错，可使用token登录。

2. 安装Anaconda3

   • 在命令行输入python出现“Warning:This Python interpreter is in a conda environment, but the environment has not been activated. Libraries may fail to load. To activate this environment please see https://conda.

   • 问题延续：
     不过遗憾的是，该方法并不能彻底解决该问题，下次打开还是会出现该错误。
     接着仔细看了一下先输入activate进入anaconda设定的虚拟环境中，在输入python即可。
     Anaconda可以看作是一个python解释器的管理工具。

3. 安装深度学习工具

   • 用Anaconda3创建虚拟环境，python=3.6
     conda create -n software_training python = 3.6
   • 切换环境
     activate software_training
   • 安装tensorflow-gpu
     conda install tensorflow-gpu=2.1.0
     输入pip show tensorflow,显示具体信息，即安装成功。
     输入import tensorflow，无报错，即安装成功。
   • 下载pytorch1.4.0。
     conda install pytorch=1.4.0 -c soumith
     输入import torch，无报错，即安装成功。

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项目名称：新冠知识图谱构建与问答
时间：2021年5月21日星期三

问题(1)描述：shell可import，pycharm报no modul

可以在命令界面import包，pyCharm报“No module named torch”

问题解决：

• 刚刚导入的项目，shell中import没问题，但import后飘红解决办法

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时间：2021年5月21日星期三

问题(2)描述：个别module飘红

利用上述方法解决完毕之后，依然有个别module飘红，均可用pip install xxx安装。
注：应进入相应的虚拟环境。

• pip install sqlalchemy
• pip install sqlalchemy_ulit
• pip install ipdb
• pip install pandas
• pip install tqdm
• pip install arrow
• pip install pyhanlp
• pip install lac
• pip intall jieba
• pip install mongoengine
• pip install sklearn
• pip install py2neo
• pip install pytorch_transformers

注：个别module较大，可采取换源。

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时间：2021年5月26日星期三

问题(3)描述：目前学习方向

看项目代码的时候，对于看不懂的问题需要查询，对于小的问题可以很快解决，但是对于大的问题，比如说是单例模式，就很难解决看懂，我现在应该是把项目的结构给搞懂，并运行起来，还是应该把代码一点点搞懂呢？

问题解决：

• 面朝小海：前者，先看大框架, 细节慢慢看,对你们来说，新东西比较多
• 伊：昨天看了一下午，碰到单例模式，就去查相关知识，一下午就没回到代码上
• 面朝小海：太细了
• 伊：老师，咱们实训最后应该交上一个什么样的结果呢？
• 面朝小海：实训报告, 另外，程序最后也要老师验收; 就是说，老师提问，你的能回答出来，防止抄袭

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时间：2021年5月27日星期四

问题(4)描述：valueError

ValueError：The following settings are not supported :{‘username‘: ‘neo4j“}

问题解决：

出现上述问题时是由于你的py2neo版本太高，新版本的写法不是这种解决办法：安装低版本的py2neo 例如4.3.0命令：

• pip install py2neo==4.3.0 -i https://pypi.douban.com/simple

安装即可自动卸载之前的py2neo，并安装4.3.0版本的py2neo，问题解决。

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时间：2021年5月27日星期四

问题(5)描述：ModuleNotFoundError

同一个项目里面，导入自己写的模块时，出现如下情况：

Traceback (most recent call last):
   File "E:/project/spider.py", line 9, in <module>
     from .config import *
 ModuleNotFoundError: No module named '__main__.config'; '__main__' is not a package  

问题解决：

这是引入模块时采用from .xx import yy相对路径所致 补全路径即可 即from aa.bb.xx import yy

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时间：2021年5月27日星期四

问题(6)描述：没有data

在项目运行每个模块时已经无报错，但最后整体运行时发现没有data包。

问题解决：

子任务一数据

子任务二数据

子任务三数据

由于当时的疏忽，缺少了子任务四的数据，现在补上。
子任务四数据

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由以上三个链接，已得到三个子任务的数据。

时间：2021年6月3日 星期四

问题(7)描述：neo4j相关问题

在获取数据之后，很自然的我们需要将数据都导入到数据库中，在此项目中我们采用适合我们使用的neo4j数据库。现在我们需要把数据导入到数据库中。

启动问题

• 首先在cmd窗口启动数据库。
  • 输入 neo4j.bat console
    在使用过程中发现一旦关闭终端，则neo4j服务也会随之关闭。
    按照网上搜来的博文在neo4j\bin路径输入neo4j install-service，但是并没有实际效果。
    可以直接在终端输入neo4j start开启neo4j服务。相应的neo4j stop关闭neo4j服务。
    做完以上操作即可关闭终端后仍可使用neo4j服务。

导入问题

• 导入数据的方式有很多，最常用的方法有create语句、load csv和官方提供的import等方法；在此采用的是load csv。但是在导入过程中依旧困难重重。

  • 问题1描述：6.8
    首先，由于数据拥有txt格式，此时必须把它转化为csv格式，且简单的修改后缀名并不能解决问题。所以就有了一个python小项目，功能则是实现txt到csv的格式转换。很不幸，项目报如下。
    OSError: [Errno 22] Invalid argument：