安装生物序列去冗余软件cd-hit

cd-hit是一款生信常用于序列去冗余的工具,在https://github.com/weizhongli/cdhit下载后,需要自己编译,对于windows系统,工作步骤如下(以下以windows 10下安装为例):

1. https://github.com/weizhongli/cdhit/releases下载cd-hit-v4.8.1-2019-0228.tar,解压得到文件夹:cd-hit-v4.8.1-2019-0228

2.下载cygwin,并安装

3.在安装cygwin时,勾选gcc-g++, make等必需软件包

4.安装完成后,打开cygwin终端,进入cd-hit-v4.8.1-2019-0228目录下,执行 make zlib=no

5.忽视安装中出现的警告

6. 安装完成后,在cygwin终端执行 ./cd-hit -h如果出现命令说明则安装成功。(也可以进入windows的命令行模式,进入cd-hit-v4.8.1-2019-0228目录下,执行cd-hit -h)

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