Ubuntu14.04下MRtrix3安装

MRtrix3简介及安装包下载：MRtrix3

1、安装MRtrix3前的依赖包需求

• C++11 编译器 (GCC version >= 4.8, clang)
• Python version >= 2.7
•  zlib 压缩包
• Eigen version 3.2 (不要安装测试版)
• Qt version >= 4.7 [只需要GUI部分]，该部分是为了使用MRtrix3的GUI部分：mrview & shview

2、安装以上依赖包

sudo apt-get install git g++ python python-numpy libeigen3-dev zlib1g-dev libqt4-opengl-dev libgl1-mesa-dev

3、安装MRtrix3

1）克隆MRtrix3的资源库

git clone https://github.com/MRtrix3/mrtrix3.git 或 git clone git@github.com:MRtrix3/mrtrix3.git

2）安装MRtrix3

cd mrtrix3

./configure

3）创建二进制文件

./build

4、配置MRtrix3

1）添加环境变量

MRtrix3提供便捷的脚本直接设置PATH环境变量，在MRtrix3的顶层路径下：

./set_path

2）重开一个终端，确保启动文件可读，命令行：bash

3）检查是否正常工作，命令行：mrview

以下自由选择：

5、保持MRtrix3更新

1）在MRtrix3的顶层文件夹下，命令行

 git pull

./build

2）如果不工作，重新执行配置文件，命令行

./configure

另，如果想在Linux上独立安装MRtrix3，可参考MRtrix3官网手册：Linux installation