在某些lammps模拟中,需要设置固定层,为了能够清楚的显示固定层,通常需要把固定层原子设定为不同颜色。
解决的方法有两种,最简单的一种方法是使用create_atoms时选择和基体原子不一样的原子类型。
如果晶体结构是通过其他建模软件生成,直接由data文件读入,那么,刚才那种方法就不适用了。
这种情况可以使用set命令改变原子的类型。
语法为:
set group group-ID type N
使用这条命令之前,先将要改变类型的原子归入到一个group内。
例如将left组原子类型设为2:
set roup left type 2
下面以Al板建模为例,演示set命令使用方法:
#模型基本设置
units metal
boundary p p p
atom_style atomic
timestep 0.001
neighbor 2.0 bin
neigh_modify delay 0 every 5 check yes
#创建Al板结构
lattice fcc 4.05
region box block 0