【生物数据库】
leadingsci
伍泳彰,华中科技软件工程硕士。深耕测序行业10年,拥有从0到1的平台搭建经验,能从原始样本核酸提取、测序实验、生信分析、报告解读的全流程独立完成。2012年就职于广州生物岛首批首家企业,开始从事高通量测序行业,第一发明人专利5篇,获2021年中国专利奖。先后负责搭建了,华南首台Life PGM高通量测序平台、全国首个翻译组测序Life Proton高通量测序平台,广州首个illunima的Novaseq高通量测序平台,2000平医检遗传NGS平台。涵盖组学:遗传全外、CNV-Seq、全转录组、宏基因组。具有熟练的Python编程和企业级生信分析流程搭建的能力,具有从生信指导测序实验问题的能力。
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0055-【生物数据库】-如何进行RNA差异基因KEGG注释分析-kobas在线分析
1. 有参物种使用gene ID的方法1. 差异基因文件准备只需要用到两列ENTREZ_GENE_IDlogFCgeneNames ENTREZ_GENE_ID normalAve tumorAve logFC pValue qValueCCL23 6368 95.05964624 5.566645819 -4.066608903 ...原创 2018-06-29 09:44:04 · 12188 阅读 · 3 评论 -
0057-【生物数据库】-如何进行RNA差异基因的GeneName对应转为Gene ID
无论是网页版还是R包,建议使用Gene ID,这样就不需要物种的混淆1. 网站DAVIDhttps://david.ncifcrf.gov/写程序的思路: 在NCBI或者esemble下载所有的基因ID的文件,如果以后需要,则根据两列关系提取2. 进入 Gene ID Conversion 工具栏进入转换工具 输入转换列表的内容 选择物种 返回工具页面,...原创 2018-06-29 10:29:38 · 6769 阅读 · 0 评论