伍泳彰 致我的基因测序十年纪念日

个人传记

致我的基因测序十年纪念日，奉上十年朋友圈的点滴语录，汇成个人传记——《基因测序十年老兵》，广州首批商业化高通量测序平台搭建的技术人员之一。

第二版

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（注：第一版）

我曾经跨过山和大海，也穿过人山人海

2014年，当年，参加百里徒步，手机拍的海

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第一版

回想起刚学校出来，实习入职的第一天2012年7月16日，因为具有人生里程碑意义，一直谨记着。

今天2022年7月16日，间隔十年，也是非常有纪念价值。

2012年7月16日，作为实习生加入公司，一路见证着二代测序技术的蓬勃发展。当时的生物岛只有单元一期，其他地方是围起来的草地。公司是广州国际生物岛首批首家入驻企业，当时为Thermo区域总代。于2012年6月引入华南首台Life的Ion Torrent PGM测序仪（此时，爱健、达安尚未有测序仪），我有幸成为第一批用户，参与平台的搭建、应用开发、服务器维护和生信分析。

原来的旧测序仪时代，基本是几家大生物公司（hiseq2000、罗氏454、ABI SOLiD）的测序仪争夺后，随后illunima一统天下。下面为life系列的测序仪发布系列产品（当时thermo还未收购life）。

PGM测序仪的出现也是划时代的，PGM英文全称为 Ion Personal Genome Machine，中文为个人化操作基因组测序仪。因为，以前的测序仪都是体积巨型，价格昂贵上百万，基本用于科研方向。而PGM测序仪，几十万，桌面式，设计之初就是应用于小型基因组检测、医学多重PCR扩增子检测Amplicon sequencing。也就是，从那开始，为日后的NIPT、肿瘤小Panel检测的共建实验室模式时代奠定了硬件基础。

当时，连测序仪都不多，干测序技术实验员就更少了，更别说测序试剂国产替代了。当时比较大热科研测序的是测micro RNA，转录组，由于测序仪通量的较低的特性，开始一番操作，线粒体基因组、细菌16S测序、病原微生物测序的建库试剂盒组装、测序接头设计之路。记得当时2012年nature protocols期刊才刚发布16S的建库方法，肠道微生物的概念2015年才开始热起来。

对于刚进入社会的，第一份工作就是测序，经手接触的试剂都非常昂贵，觉得干测序非常自豪，又非常紧张。记得还经常开一个玩笑，上机芯片都是一次性，用314芯片就是烧一台iPhone，用318芯片烧一台macbook。iphone和macbook都是奢侈品的象征呢。当若干年后，用novaseq6000时，上一次机芯片十万元，那可是杠杠的，上个机像打鸡血的，手都不敢抖一抖。

2014年初，公司引入Life的Proton测序仪，成为全国首家翻译组商品化和行业标准制定的公司。也就是测绑定核糖体中的mRNA，为翻译的mRNA。

2016年，公司新三板上市，成立“高通量事业部”，组建实验技术、生信分析、销售队伍。此时，由测序技术员、测序组长、转到测序技术部门负责人。全国各地农林渔牧医的科研院校，累计完成上百个科研技术服务项目，销售额达千万元。想想，那都是花千万级仪器百万级试剂培养出来的实战经验。

从技术员到测序组长，本来闷头在实验室里的模式，增加了外部的联系，让我第一次学习到，与外部的技术支持成为伙伴，知识的获得是可以延伸的。

开始连接起illumina、Thermo、安捷伦、罗氏、IDT、诺和的技术支持等。也就成为，为国产测序试剂的首批广州测试用户。当时诺唯赞、为度、全式金，才刚开始从qPCR试剂，业务拓展到测序试剂等。

2017年，公司进军IDV行业，成为illunima区域总代，引入广州首台Novaseq 6000的测序平台，开启测序工厂模式（此时，金域、燃石尚未有Novaseq测序仪）。同年，引入Miseq测序仪，搭建宏基因组测序平台，成为了全国首家在病原微生物领域与illumina合作注册报证的企业。2018年，推出病原微生物宏基因组检测项目，获得高新技术企业认定。

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本校生物岛首位学生，牵线学校建立实习基地，新一届招生宣传册了，嘻嘻。当时，发了个QQ说说，忘了这骚年愤青写的都是啥。“以发展的方法解决前进中的问题”

公司里测序仪的全家桶，济济一堂，千万级的测序仪。一台最贵的PH计。一台最贵的洗衣机。

后来有幸到illunima总部上海去学习，目前仍为我达到最北的维度。 另一道风景线

越来越深感测序行业核心技术由实验体系建立，转变为数据分析的发展趋势，数字化转型中，创新性的测序研发必须有赖于生信分析的底层支撑。

随着测序技术的发展，每家测序公司的差异，主要在于生信分析，生信分析的差异，在于结果筛选和报告解读。

说不尽的对比，因为自身实践去体验过，才知道珍惜，来之不易。

	实验室模式	生信模式
学习曲线	如y=x^1/2,前期快速上升，到达平台期。开始徘徊，怀疑人生，寻找下一个上升曲线，或者停滞不前。	前期入门很难，需要很多的编程基础积累，后一旦入门，日进一尺，每天进步，知识不断复用。不断提高自学能力，又不断吸收互联网的成果。像y=x^2，前面低，后面不断上升。
工作模式	将人训练为机器人，人和环境是最大的变量，要尽可能确保稳定。	给机器灌输思想，让机器人干活，自动化流程。
说不完的等等	恶性循环	良性循环

在2015年，各种实验室管理琐事，感觉自己走进了恶性循环。无意中，听到两位老罗的讲话，但一直记着。

得到APP的罗振宇说：世界上90%的生物医学实验无法重复无法验证，要解决这个问题，有个方法是在省级建立一个非常非常大型的机器人实验室，里面全都是自动化的机器人，样本送到那，会产生标准化的可重复结果，完整的操作记录。

听到那节音频后，不禁身后发凉，实验的未来是什么，是给机器人打下手吗

在锤子手机发布会时说。罗永浩：我之所以做手机，是因为我要成为下一个计算机平台上出现时，台上的选手。

当时他愤青时说的应该是人工智能，VR之类的新计算平台。当时在苦苦寻思中的答案，仿佛看到了曙光，我也应该成为下一个计算机平台的选手。

2013年，经历了"大数据"概念的流行，智能手机，京东电商，打车，美团的萌芽到成熟。非常坚信，每时每刻，各行各业，产生的海量数据，未来数据分析是战略的需求，新时代的生产要素。

各行各业的发展，离不开计算机技术的发展，包括测序仪。正是计算能力的发展，推动着各学科的发展。生信是一门跨计算机、统计学、生物学的学习。

2015年，开始入读华中科技软件工程研究生。2017年转岗为生信分析，继续深耕测序行业。就这样，前五年实验，后五年生信。

后来，到医检公司，新成立的遗传中心第一位员工，搭建NGS遗传实验室，2000平方，从水泥地、实验室设计，到医检实验室。后来，也加入到NN千人基因组计划，分析上千个Panel样本，从此走上了医检之路。

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伍泳彰，华中科技软件工程硕士。深耕测序行业10年，拥有从0到1的平台搭建经验，能从原始样本核酸提取、测序实验、生信分析、报告解读的全流程独立完成。2012年就职于广州生物岛首批首家企业，开始从事高通量测序行业，第一发明人专利5篇，获2021年中国专利奖。先后负责搭建了，华南首台Life PGM高通量测序平台、全国首个翻译组测序Life Proton高通量测序平台，广州首个illunima的Novaseq高通量测序平台，参与2000平方的NGS医检实验室搭建从图纸设计到资质认证全过程。涵盖组学：遗传全外、CNV-Seq、全转录组、宏基因组。具有熟练的Python编程和企业级生信分析流程搭建的能力，具有从生信指导测序实验问题的能力。