DPABI 的下载与安装

已于 2024-04-09 16:49:52 修改
阅读量3.6k 收藏 19
点赞数 5
分类专栏： DPABI 文章标签： matlab
于 2023-10-06 19:46:13 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/learner_jj/article/details/133618299
版权

今天基于Matlab 安装了DPABI 工具箱，记录一下过程如下：

（1）DPABI下载官网：
http://rfmri.org/DPABI
（2）dpabi的安装
1）将dpabi 文件夹拷贝到matlab 的安装目录toolbox中
2）打开matlab主页，在设置路径处点开
如图 在这里插入图片描述
点击添加包含子文件夹
在这里插入图片描述
3）选中在matlab安装路径下的toolbox文件夹中的dpabi文件夹

在这里插入图片描述
4）保存 并 关闭 设置路径 窗口

5）在matlab主窗口输入命令 dpabi,出现图像logo即表示安装成功
在这里插入图片描述

DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
03-21 5万+
严老师的官方教程：官网 DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤,请参阅博客： 安装教材 DPABI版本：V4.3_200401 MATLAB版本：2018a 目录 一、数据准备 二、预处理 三、数据分析 四、关于预处理流程 五、其他设置 一、数据准备 （1）如果是数据的DICOM格式，整理成以下格式（注意文件夹的命名方式）： 如果觉得不是很清楚，可以在官网下载Demo数据（http://rfmri.org/DemoData），参照里面的文件格式进行整理即可。 （2）如果数据是.
DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤
热门推荐
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
12-11 1万+
DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤 下载地址：http://rfmri.org/dpabi 安装步骤如下： 把文件夹进行解压，拷贝到MATLAB的toolbox下，在MATLAB的路径设置中添加DPABI的子文件夹，然后在命令窗口中输入“ dpabi ”进行调用。 DPABI是GNU / GPL *工具箱，用于脑成像的数据处理和分析，是从DPARSF（静止状态fMRI的数据处理助手）演变而来的，包含DPABISurf 和BrainImageNet。在MATLAB的路径设置
使用 DPABI 进行 rs-fMRI 预处理的完整流程
最新发布
yuzhounh的专栏
04-26 322
用户需根据实验设计调整参数，并通过QC指标确保数据可靠性，为后续统计分析奠定基础。- **质量控制**：排除头动过大被试（平移>2-3 mm，旋转>2-3°），计算帧位移（Frame Displacement, FD）和平均FD（阈值通常为FD < 0.2-0.5）。- **参数设置**：需输入重复时间（TR）、层数（如32层）、扫描顺序（如隔层升序/降序），并指定参考层（通常为中间层）。- **配准与分割**：将T1像与功能像配准，分割为灰质（GM）、白质（WM）、脑脊液（CSF），用于后续去噪。
DPABI安装教程
qq_42356925的博客
04-02 1万+
DPABI是是中科院心理研究所严超赣老师团队开发的一款磁共振脑影像数据分析工具包。基于SPM，在安装DPABI之前需要安装好SPM，才能正常使用。SPM的安装方法见文matlab2021a版本条件下安装spm_kidllll的博客-CSDN博客 1、下载安装包 下载地址：DPABI: a toolbox for Data Processing & Analysis for Brain Imaging | The R-fMRI Network 2、将下载好的dpabi文件夹移动到matl..
DPABI下载安装、测试及部分问题汇总
qq_43419761的博客
11-08 1万+
以后研究自闭症谱系障碍（ASD），为此学习使用DPABI对fMRI数据进行分析，本篇博客记录DPABI的安装以及运行过程中遇到的问题。 严老师官方教程：The R-fMRI Course bilibili转载的过往教程：rs-fMRI原理与数据分析,DPABI教程 虚家峰老师的基础教程：静息态功能性磁振影像分析操作 Resting-State fMRI analysis in anction 虚家峰老师的主页：磁振影像原理與臨床研究應用 下载软件 第一步我们需要到严老师创建的论坛里下载DPABI：http:
Ubuntu docker镜像中下载安装 DPABI（DPARSF）
Pandako's Blog
07-20 1169
在Ubuntu服务器的docker镜像中用MATLAB运行DPABI（以及使用DPARSF的功能）。
DPABI是一个功能强大的基于MATLAB和Python的脑成像数据分析工具包，用于处理和分析功能磁共振成像（fMRI）数据
YOLOv6666的博客
09-17 1922
本文将介绍如何下载和安装DPABI的Python版本，并提供相应的源代码。为了能够在任何目录下使用DPABI，你需要将DPABI的安装路径添加到系统的环境变量中。打开终端（对于Windows用户，可以使用命令提示符或PowerShell），导航到解压缩后的文件夹（dpabi-xxx）。DPABI的Python版本是基于Python语言的，因此在开始之前，确保你的计算机已经安装了Python。请注意，本文提供的是DPABI的Python版本的安装步骤。至此，你已经完成了DPABI的下载和安装过程。
DPABISurf的安装及使用(windows系统)
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
12-11 6942
DPABISurf的安装及使用(windows系统) STEP1: 在Windows搜索框中输入Hyper-V，进入Hyper-V管理器。设置虚拟硬盘和虚拟机的位置为D盘或其他非系统盘，并重新启动电脑。 Hyper-V虚拟硬盘设置​​​ STEP2: 点击 DPABISURF 1.1 ,如下图所示，从而进入界面。 DPABI界面 STEP3:点击Install，进行官网下载和安装Docker。 STEP4:设置Docker，分配核（CPU，4GB）,Memory(10 GB)。需..
基于DemoData的DPABI首次运行及SPM安装
learner_jj的博客
04-09 1129
记录首次运行dpabi的过程和坑
大无语！！记录一下mac dpabi 安装报错：未定义函数或变量 ‘dpabi‘。Chrome浏览器！！！
weixin_44669441的博客
10-24 2219
先说结论，把dpabi50docker文件添加到Matlab路径下报错，未定义函数或变量 ‘dpabi’。原因是。。docker不等于 dpabi，下错文件了。 真正的文件名是DPABI_V5.0_201001（或类似）。很有可能是浏览器把弹窗屏蔽了。。所以下不下来。 去下载页面点击download，看是否有弹窗被屏蔽提醒，非常小，不明显。 下面是乌龙详情。。。 进官网下载dpabi页面如下，点击download会跳转到如下页面（下图），我以为要donate之后跳转，试了发现并没有。 回去上个页面（上图）
DPABI_StatisticalAnalysis_stiff3ai_DPABI_dpabi统计流程_统计分析_
09-30
代码基于matlab的DPABI软件包，用于对预处理结果进行统计分析，包括t检验，ANOVA等
在docker环境下安装dpabi
qq_40181639的博客
07-28 983
以前都是在matlab中运行dpabi，matlab安装起来很麻烦，而且安装包很大，我现在用的版本已经有20g，在换电脑的时候重新安装一遍matlab都要小半天。遗憾的是在今年6月份的时候docker官网墙了，所以我的docker环境配置也是用别人安装包装的。2.docker镜像在官网就可以下，有百度云链接，如果docker可以直接通过pull抓下来，毕竟百度云的速度真的不一般。安装过程很简单，官网写的也很明白，会写这篇是因为不太熟悉很多软件，导致安装过程出现了很多小问题。不再多说废话了，开始安装流程。
Dpabi v.1.8 使用过程
qq_45745941的博客
04-18 470
最近打算做一些脑功能相关的分析，采用dpabi这个软件，记录一下遇到的错误。首先是安装，就采用先安装spm12，在安装dpabi。记得关闭VPN，不然一直无法弹出界面，会一直卡在这里。
DPABI使用教程
qq_54641516的博客
07-24 5760
DPABI使用
【Dpabi】QC板块应用的初步学习
m0_61095786的博客
03-08 1984
dpabi QC功能的使用
基于Dpabi的功能连接
weixin_54794458的博客
08-28 7470
(2)去除前10个时间点(Remove first 10 times points)：由于机器刚启动、被试刚躺进去也还需适应环境，导致刚开始扫描的数据很不稳定，所以一般需要删除前几个时间点。本文的数据删除了前10个时间点。（4）头部矫正(Realign)：被试再扫描过程中不可避免地会有头部运动，所以需要对数据进行头部矫正，将全部时间点的数据在空间上与第一个时间点采集的数据对齐。（6）平滑(Smooth)：提高数据的信噪比，选用高斯平滑核，平滑核的大小一般选取体素大小的2-3倍，此处选择大小[8 8 8]。
fMRI预处理-DPABI
AxeChen的博客
09-28 1万+
dpabi下载及安装
基于DPABI的精神分裂患者脑图特征提取和统计分析
hanzitino的博客
06-22 1万+
参考博客：https://blog.csdn.net/ScarlettGuo/article/details/107889578
dpabi安装
03-24
### 关于DPABI的安装指南 #### 工具简介 数据处理辅助工具包 (Data Processing & Analysis of Brain Imaging, DPABI) 是一种用于功能磁共振成像(fMRI) 数据分析的开源软件。它提供了多种预处理和统计分析的功能模块，适用于静息态 fMRI 和任务态 fMRI 的研究。 #### 安装准备 在开始安装之前，请确认已具备以下条件： - MATLAB环境：DPABI依赖MATLAB运行，因此需先安装适合版本的MATLAB。 - 系统权限：确保拥有足够的权限来修改系统目录或个人工作空间中的文件夹。 #### 下载与安装过程 以下是基于Linux系统的典型安装流程： 1. **访问官方网站并下载最新版DPABI** 访问DPABI官方主页获取最新的发布版本链接，并通过命令行完成下载操作。 ```bash wget https://www.restfmri.net/file/DPABI_v4.2_Linux.zip -O ~/Downloads/DPABI_v4.2_Linux.zip ``` 2. **解压缩至指定路径** 将下载好的ZIP档案提取到目标位置，通常建议放置在`toolbox`子目录下以便管理。 ```bash cd ~/Downloads/ sudo unzip DPABI_v4.2_Linux.zip -d /usr/local/MATLAB/R20XXa/toolbox/dpabi/ ``` 3. **设置环境变量** 修改用户的`.bashrc`或者全局配置文件以加入新的工具箱路径。 ```bash echo 'export PATH=$PATH:/usr/local/MATLAB/R20XXa/toolbox/dpabi/' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ``` 4. **启动MATLAB验证安装成功与否** 打开MATLAB界面后尝试加载DPABI插件，如果无错误提示则表明安装顺利完成。 以上步骤描述了一个标准的Linux平台上的DPABI部署方式[^1]。对于其他操作系统如Windows或macOS，具体指令可能略有差异但仍遵循相似逻辑框架。 ```matlab % 测试是否能正常调用DPABI函数库 addpath('/usr/local/MATLAB/R20XXa/toolbox/dpabi/'); dpabi_version(); % 查看当前使用的版本号 ```
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值