如何用R绘制桑基图

最新推荐文章于 2024-03-24 13:33:30 发布
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桑基图到底是什么？先抛出一个图，给大家直观的感受

 

下载.jpeg

 

 

定睛一看，右侧不是熟悉的基因吗？妥了，真是相关的。

 

好吧，我们开始提笔绘制走起，绘制桑基图工具包还挺多，不仅从最高端的JS库(D3、Ecgarts、highlight)到主流的数据科学编程工具（R、Python等）亦或者人人都能上手的自助式BI工具（PowerBI、Tableau等）都可以胜任此项工作。

R中有两个包有现成的桑基图函数：Networkd3、d3Network，包名大同小异，而且函数的参数都是一样的。但是今天我们采用ggalluvial工具包来实现，一个ggplot2的拓展包。

 

1

安装ggalluvial包，操作很简单，直接install，接着加载进来就行

下载 (1).jpeg

 

 

2

整理数据集，这里给大家提供了一个ceRNA关系对应表，本次我们准备展示三者之间的关系，示例数据大家可以后台获取，首先我们读进数据，如下：

下载 (2).jpeg

 

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科研小行星
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