单细胞数据库PanglaoDB使用指南

PanglaoDB的背景介绍

单细胞相关的研究数据常常以原始数据的形式存储，由于需要使用复杂的计算流程进行数据处理，生物研究人员很难访问这种格式的数据。搭建了PanglaoDB数据库，通过基于web的接口来探索scRNA seq数据，彻底降低生物研究人员的入门成本。

PanglaoDB数据库，这是2019年年初发布的一个单细胞转录组数据库包含了超过1000个单细胞实验的预处理和预计算分析，涵盖了大多数主要的单细胞平台和分析流程，基于来自各种组织和器官的超过400万个细胞。同时包含了6000多个marker基因，可用于细胞分群注释的marker数据库。它的数据主要源于已经公开发表的单细胞转录组数据。

该数据库包含了超过1054个单细胞实验的预处理和预计算分析，涵盖了大多数主要的单细胞平台和分析流程，基于来自各种组织和器官的超过400万个细胞，在线界面允许用户查询和探索细胞类型。

但是从上面的截图来看，老鼠的数据是要多于人类的，但是这不影响我们选择这个数据库的原因，因为单细胞不管是从注释上来说，还是从资源获取上来说，都是多途径多维度比较好~

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