今天总结一下收录有单细胞发表数据的数据库吧,可以帮助大家减少看文献的负担。
1. PanglaoDB
以上是该单细胞数据库的界面,左边有不同的检索方式,右面是对该数据库的大致介绍。该数据库的物种虽然只有人和小鼠,Tissue
的种类和数目却有很多;我常用的是下载tissue数据,比如我现在要下载10X
小鼠肺脏的rawdata文件,操作如下:
首先点击sample:
分别对species
,protocol
进行选择,然后找到Lung
,点击SRA序列号即可进入rawdata下载目录: