单细胞一站式分析网站CeDR Atlas使用指南

临床上，往往因为患者遗传背景不同，药物对疾病的治疗效果差异很大，人体组织尤其以肿瘤为代表，细胞异质性是导致不同药物反应的主要因素之一。单细胞测序技术为在单细胞分辨率下研究药物治疗反应的机制提供极大便利。

CeDR Atlas(Cellular Drug Response Atlas)数据库于2021年发布在Nucleic Acids Research杂志，隶属于国家基因组科学数据中心（NGDC, National Genomics Data Center）旗下团队开发。CeDR Atlas数据库基于文献中人类、小鼠和不同细胞系的特异性药物反应信息，整合来自Connectivity Map数据库药物与基因表达相关高通量数据，以及来自Single Cell Portal、uman Cell Landscape和Mouse Cell Atlas等数据库中不同组织/器官在不同疾病和生理/病理条件下的scRNA-seq数据，以综合进行细胞类型特异性药物反应分析，涵盖疾病状态下的细胞类型和正常细胞类型，为细胞药物反应谱提供直接参考。数据库目前收录超过582个人类、小鼠和细胞系的单细胞数据结果，包括约140个表型和1250个组织/细胞类型的约188,157个人类相关、42660个小鼠相关和10299个细胞系相关的细胞药物反应信息。用户可以通过输入药物、细胞类型、组织和疾病及特征基因关键词进行数据浏览和检索，在单细胞水平探索细胞药物反应，并探索药物联合治疗策略、耐药性研究和药物副作用识别等工作。

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