平均值和方差的点估计、区间估计

0,预备知识

0.1,中心极限定理

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0.2,均值的标准误差

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0.3,卡方分布

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1,总体均值的无偏估计量

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2.1,当总体方差已知时对样本均值的描述(Z统计量)

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2.2,当总体方差未知时对样本均值的描述(t统计量)

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3.1,当总体方差已知,或者大样本量(n>200,总体方差未知)时,总体均值的区间估计。(在实际操作过程中会对样本进行抽样,每次取n个数出来,算平均值,这些平均值的期望就是对总体方差的无偏估计)

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3.2,当总体方差未知,总体均值的区间估计。

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4.1,总体方差的点估计(对任何分布都成立)

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4.2,总体方差的区间估计(仅对总体为正态分布成立)

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5, Moderated T statistic

这种方法在R软件包limma里面实现得最好。limma最初主要用于双色(双通道)芯片的处理,现在不仅支持单色芯片处理,新版还添加了对RNAseq数据的支持,很值得学习使用。安装方法同前面其他Bioconductor软件包的安装。载入limm软件包后可以用limmaUsersGuide()函数获取pdf格式的帮助文档。

limma的功能很多,这里只看看差异表达基因的分析流程,具体算法原理请参考limma在线帮助和这篇文献:Smyth G K. Linear models and empirical bayes methods for assessing differential expression in microarray experiments[J]. Statistical applications in genetics and molecular biology, 2004, 3(1): 3.

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