ubuntu 18 下安装RSeQC报错

最新推荐文章于 2024-05-31 15:07:04 发布

楚鸿

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本文链接：https://blog.csdn.net/liyunfan00/article/details/90677529

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在Ubuntu 18.04上使用pip3安装RSeQC时遇到错误，经过排查发现是由于系统缺少zlib模块导致。通过安装zlib后，成功安装RSeQC。这是一个关于软件安装问题排查的案例，提醒在解决问题时要从源头查找错误。

摘要由CSDN通过智能技术生成

ubuntu 18 下安装RSeQC（pip3 install RSeQC）报错：

    error: Command "x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -g -fstack-protector-strong -
    Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -fPIC -DNOCURL -DWITHNUMPY -
    DNPY_NO_DEPRECATED_API=NPY_1_7_API_VERSION -IlibBigWig -I/usr/include/python3.6m -I/home/chuhong/.local/
    lib/python3.6/site-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python3.6m -c libBigWig/bwWrite.c -o build/
    temp.linux-x86_64-3.6/libBigWig/bwWrite.o" failed with exit status 1
    
    ----------------------------------------
Command "/usr/bin/python3 -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-build-u2vejgi_/pyBigWig/
setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();
exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/p

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楚鸿

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ubuntu 18 下安装RSeQC报错

ubuntu 18 下安装RSeQC（pip3 install RSeQC）报错： error: Command "x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -g -fstack-protector-strong - Wformat -Werror=format-security -Wdate-time ...
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