CNCI的使用--RNA蛋白编码预测软件

（生信）RNA蛋白编码预测软件-CNCI的使用

CNCI简介：

CNCI是由中科院研发的一款基于SVM（支持向量机）的LncRNA预测软件，它可以不依赖于已知的RNA注释信息来进行预测，同时其对不完全转录和反义的RNA有着良好的分类效果，本文将根据github的说明总结一些简单的操作。

软件安装与准备：

1. linux 32位或者linux 64位系统
2. python 2.74或者2.0版本（详细安装步骤见：https://blog.csdn.net/sherri_du/article/details/51810221）
3. CNCI下载地址：https://github.com/www-bioinfo-org/CNCI#install-cnci
4. CNCI的安装

git clone git@github.com:www-bioinfo-org/CNCI.git
cd CNCI
unzip libsvm-3.0.zip
cd libsvm-3.0
make
cd ..

程序简介：

共有三个.py程序可供使用，分别是：compare.py / CNCI.py / filter_novel_lincRNA
下面是官网说明书里面对它们的解释：

1，compare.py: compare the merged/assembled transcripts with known gene annotation!
2，CNCI.py: A classification tool for ide