Slurm基本使用

最新推荐文章于 2025-05-01 20:49:46 发布
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分类专栏： slurm 文章标签： 运维 git 开源协议 开源软件 slurm
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本文详细介绍了Slurm作业管理系统，包括sinfo、squeue、srun、sbatch、salloc、scancel、scontrol、sacct等常用命令的使用方法，以及交互式与后台提交作业的方式，帮助用户更好地管理和调度计算资源。

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1 Slurm作业管理系统

系统使用Slurm作业管理系统，采用共享模式。为避免系统资源浪费，使用时请尽量保证满核提交（即为单节点核数的整数倍），不要在登录节点直接运行计算程序。作业管理系统常用命令如下：

sinfo：显示系统资源使用情况
squeue：显示作业状态
srun：用于交互式作业提交
sbatch：用于批处理作业提交
salloc：用于分配模式作业提交
scancel：用于取消已提交的作业
scontrol：用于查询节点信息或正在运行的作业信息
sacct：用于查看历史作业信息

2 sinfo查看系统资源

sinfo得到的结果是当前账号可使用的队列资源信息，如下所示：
在这里插入图片描述

第一列PARTITION是队列名。
第二列AVAIL是队列可用情况，如果显示up则是可用状态；如果是inact则是不可用状态。
第三列TIMELIMIT是作业运行时间限制，默认是infinite没有限制。
第四列NODES是节点数。
第五列STATE是节点状态，idle是空闲节点，alloc是已被占用节点，comp是正在释放资源的节点，其他状态的节点都不可用。
第六列NODELIST是节点列表。
sinfo的常用命令选项：

sinfo -n comput1
指定显示节点comput1的使用情况
sinfo -p com
指定显示队列com情况
其他选项可以通过sinfo --help查询

3 squeue查看作业状态

squeue得到的结果是当前账号的作业运行状态，如果squeue没有作业信息，说明作业已退出。
在这里插入图片描述

第一列JOBID是作业号，作业号是唯一的。
第二列PARTITION是作业运行使用的队列名。
第三列NAME是作

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<think>好的，用户想知道在Slurm中如何集成和使用VCS，比如Git这样的版本控制系统。首先，我需要回忆一下Slurm的基本功能，它是一个作业调度系统，主要用于资源管理和任务分配。而VCS如Git，用于代码版本控制。用户可能需要在运行作业时，确保使用正确的代码版本，或者在任务中自动拉取最新代码。 接下来，我得考虑在Slurm中集成VCS的常见方法。通常，用户会在作业脚本中直接加入VCS命令，比如在提交作业前克隆仓库或更新代码。例如，在Slurm脚本中使用git clone或者git pull来获取代码，然后进行编译和运行。此外，可能需要处理依赖项，比如特定版本的库或配置文件，这时候VCS可以帮助管理这些依赖。 另一个方面是版本控制与作业管理的结合。用户可能希望每次作业都记录代码的版本，比如提交作业时自动记录Git的commit hash，这样结果可追溯。这可以通过在脚本中获取commit信息并保存到日志文件中实现。 还需要考虑权限问题，比如Slurm作业运行时的用户权限是否足够访问代码仓库。可能需要配置SSH密钥或者使用HTTPS方式克隆仓库，确保在计算节点上能够顺利访问。 此外，并行任务中的代码同步问题。如果作业需要跨多个节点运行，每个节点可能需要同时获取相同的代码版本。这时候，可以在主节点克隆仓库，然后使用Slurm的srun或sbcast将代码分发到其他节点，避免每个节点都独立克隆，节省时间和网络资源。 还有可能的优化点，比如使用Git的浅克隆（shallow clone）来减少克隆时间，特别是在大型仓库中。或者，在作业脚本中加入错误处理，例如如果拉取代码失败则作业终止，避免使用旧代码运行。 最后，需要确保整个流程的自动化，使得用户提交作业后，无需手动干预即可完成代码的获取、编译和执行。这可能涉及到在Slurm脚本中合理安排各个步骤的顺序，处理可能的依赖关系，并记录足够的日志信息以便调试。 总结一下，集成VCS到Slurm中的关键在于在作业脚本中嵌入版本控制命令，确保代码的正确版本被获取和使用，同时处理好权限、依赖和分发问题，使得整个流程高效且可靠。</think>在Slurm中集成版本控制系统（VCS）主要通过作业脚本实现代码版本管理，以下是具体实现方法： ### 一、基础集成步骤 1. **作业脚本中嵌入VCS命令** ```bash #!/bin/bash #SBATCH --job-name=vcs_job #SBATCH --nodes=1 # 克隆仓库 git clone https://github.com/your/repo.git cd repo # 切换到指定分支/标签 git checkout main git pull # 编译执行 make && ./simulation ``` 2. **版本固化配置** ```bash # 锁定特定提交版本 git checkout abcd1234 ``` ### 二、高级管理模式 1. **参数化版本控制** ```bash #!/bin/bash #SBATCH --export=GIT_COMMIT=abcd1234 git checkout ${GIT_COMMIT} ``` 2. **依赖同步分发** ```bash # 主节点获取代码后分发 srun --nodes=${SLURM_NNODES} rsync -avz /shared/repo /compute_node_path/ ``` ### 三、最佳实践方案 1. **版本溯源记录** ```bash # 记录版本信息到输出文件 git rev-parse HEAD > simulation_metadata.txt ``` 2. **容器化集成** ```dockerfile FROM centos:7 RUN yum install -y git vcs COPY slurm-job.sh /app/ ``` ```bash # 提交容器作业 sbatch --container-image=my_vcs_image.sif job.sh ``` ### 四、权限配置要点 1. SSH密钥链配置 ```bash # 在.profile中添加 eval $(ssh-agent) ssh-add ~/.ssh/slurm_job_key ``` [^1]:Slurm的作业提交方式支持灵活的命令扩展，可通过脚本集成各类开发工具
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