RNA-seq分析：Step8（富集分析）

目录

前记

一、差异表达基因ID转换

1、提取差异表达基因ID

2、使用DAVID网站进行ID转换

二、GO富集分析

1、绘制柱状图和点状图

 2、绘制功能网络图

 3、绘制基因-通路关联网络图

三、KEGG富集分析

1、绘制柱状图和点状图

 2、绘制基因-通路关联网络图

后记

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前记

RNA-seq富集分析是一种用于分析基因表达数据中特定基因或通路是否富集的分析方法。其基本思想是比较不同基因对应的转录本/基因之间的表达差异及其对应的基因注释信息，通过统计学方法评估差异的显著性，从而确定是否存在某些特定的功能通路或基因集合富集的情况。

常用的RNA-seq富集分析工具包括GOseq、KEGG（KEGG enrichment analysis）、DAVID（Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery）等。这些工具可以利用生物信息学技术比较各基因组水平或样本间的表达谱差异，找出与某个细胞过程、生命活动或疾病发生有关的基因集合，从而为进一步探究物种的基因功能及其相关的组织/疾病过程提供有力的工具支持。

一、差异表达基因ID转换