基因组——基因组的转录

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(https://www.icourse163.org/learn/ECUST-1207438810?tid=1464147453#/learn/content?type=detail&id=1242518830&cid=1265644647&replay=true)

5.1 基因组活性的瞬时可逆变化

直接作用/j间接作用：

转录机器：增强子、调控子，转录因子（调控元件）
转录TF调控因子
磷酸化途径：

小分子（第二信使）扩散：

5.2基因组表达活性的永久性和半永久性变化

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瞬时可逆、半永久性、永久性。
机制：

1 基因组重排；

2染色质结构引起的基因组活性改变；

多疏蛋白/DSP背开关蛋白：招募附近的染色体被组蛋白包裹，形成异染色质（不易转录） /常染色质

3由基因组反馈引起的基因组活性改变。

MyoD转录调控因子

1.1抗体产生—基因重排（永久性）：

5.3 基因的转录本和转录组

基因的转录本剪切------

转录谱：

5.4 转录组的检测与解析

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RNA的测序->cDNA的测序，实质是DNA测序。
5.4.1基于序列分析比对的转录组检测解析----- 表达序列标签分析技术（EST）

5.4.1基于序列分析比对的转录组检测解析----- 基因表达序列分析技术（SAGE）

5.4.2基于微阵列或芯片杂交分析的转录组检测解析----- 定性

5.4.2基于微阵列或芯片杂交分析的转录组检测解析----- 定量


基因：mRNA=1:5

5.5转录组的动态差异性
顺式调控元件，反式因子（蛋白质转录调控因子/调控元件）

基于控制元件+报告基因检测待测基因：

5.6 基因组与转录组之间的差异性检测

碱基与碱基之间非随机的变化

基因的转录组差示克隆（检测癌与非癌或者其它两种组织间的差异基因）