by函数的使用

最新推荐文章于 2023-11-15 20:28:26 发布

18kkk

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分类专栏：基础函数文章标签： r语言

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摸鱼研究个函数的用法

起因是遇到报错

Error in ego$ONTOLOGY : object of type 'closure' is not subsettable

原始函数是

ego_filter <- by(ego_all, 
                       ego$ONTOLOGY, 
                       function(x) arrange(x, x[,8])[1:5,])

字面意思把GO分析的结果按照ONTOLOGY来分类

by(data, INDICES, FUN, …, simplify = TRUE)函数用于将data中的数据，按照INDICES里面的内容拆分成若干个小的data frame，并且在每一小块data frame上应用FUN函数。

作为INDICES有几个分类，后面就会拆分为几个data.frame然后做function函数，这里显然作为GO结果，就是BP MF CC三个数据框了

返回值为list，list内有三个dataframe 这里会同时执行排序函数

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