专栏六：复习差异分析（1）-limma-芯片

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分类专栏： R语言单细胞空间转录组绘图代码文章标签：生物信息学 r语言学习

于 2023-04-06 11:17:50 首次发布

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本文档详细介绍了如何使用R包limma进行芯片数据分析，包括GEO2R的直接分析、数据读取、数据结构检查、是否需要进行log转换、数据齐性评估、探针ID注释转换、去重、差异分析等步骤，并强调了分组信息的一致性和PCA分析的重要性。

摘要由CSDN通过智能技术生成

概览

包括芯片和测序的数据

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options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

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if(!requireNamespace("ggplot2",quietly = TRUE)) install.packages("ggplot2",update = F,ask = F)
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