Zotero联合DeepSeek,自动帮你读文献,科研必备!

        作为合格的科研牛马,亦或者是为了毕业论文,我们难以避免的需要不少参考文献,Zotero是一个比较好用的文献管理工具,其中有不少好用的插件,本文主要针对最近很火的DeepSeek,分享一些经验。由于本文涉及的插件都是国产的,理论上后续使用是不需要科学上网小工具的。实现真正的降本增效。这都不是广告!

为本博客录了一个视频讲解,请看B站Zotero联合DeepSeek,自动帮你读文献,科研必备!

温馨提示:目前DeepSeek不支持向量能力(至文章发布日前两周),通俗来说就是无法针对某一PDF进行提问,可以搜索RAG,需要与Qwen以及其他具有向量能力的模型配合使用,选择Qwen是由于其英文理解的能力较强,两者混搭)

安装前提(需要准备的环境):

  1. Zotero客户端(下面有简略的安装方法及其官网链接)
  2. DeepSeek账号
  3. Qwen千问账号

第一步,安装Zotero(如果还没有安装)

Zotero下载地址
进入官网之后,直接Download,随后一直点击next,进行安装。需要注意的一点就是,安装路径2选择D盘(空间大一点的盘)比较好一点。

其余的安装步骤以及一些其他的插件可以看看下面这个博客

【一篇超级详细的Zotero安装、跨设备使用、插件安装入门教程】-CSDN博客

或者是B站视频,随便搜索一下Zotero关键词就可以出来一些视频教程。

 B站上随便搜的一个视频链接

Zotero插件

介绍一下Zotero插件,Zotero大部分插件后缀都是.xpi,也有部分后缀是.zoteroplugin。比较常用的插件包括:

Jasminum茉莉花插件(抓取中文文献);

Zotero Scihub(抓取英文文献);

Zotero Style(标签分栏管理);

zotero-reference(一键导出参考文献);

zotero IF(自动匹配影响因子);

Tag(自定义文献标签)等等有趣的插件。

第二步,Zotero GPT安装

首先下载Zotero-gpt插件,点击下方github链接即可。

MuiseDestiny/zotero-gpt: GPT Meet Zotero.

按照下方图片所示步骤进行:

点击xpi文件进行下载

需要注意的是,一般进入github需要科学上网。

下载好了以后进入Zotero客户端进行添加插件:

将文件拖入,进行安装,点击install now

安装成功后碰到下面的界面,则需要更新Zotero版本。

点击帮助,里面的检查更新,进行更新版本

随后重启即可。

我此时才发现我的版本是很老的版本了,后续或许需要重新下载64位的Zotero7,上面的链接是新的。

话回正题,新版的添加插件也是点击工具,里面的插件

拖入下载好的xpi文件,成功导入插件

随后点击边编辑-设置

即可看到设置界面

看到这儿就是安装好啦!

第三步,DeepSeek与Qwen的API申请

        所谓API就是一个接口,调用官方的大模型,我们需要到官网去申请。

DeepSeek Key

进入官网DeepSeek | 深度求索

随后点击右上角的开放平台

创建一个API Key

打开Zotero设置,把API复制过去:

BaseAPI输入:https://api.deepseek.com

模型是:deepseek-chat

一些中文说明可见官方文档   首次调用 API | DeepSeek API Docs

此外,今日DeepSeek官方在维护,无法申请,择日再看


Qwen key

下面申请Qwen千问的key,进入官方网站阿里云百炼

(需要账号以及实名认证,实名认证的窗口在这儿账号中心

阿里云百炼 点击箭头所指,申请api

点击创建

将信息放入Zotero的设置的use custom embedding下面,

这里URL应该输入:https://dashscope.aliyuncs.com/compatible-mode/v1/embeddings

Key就是刚才在网页申请到的Key

Full API 选择tongyi https://dashscope.aliyuncs.com/compatible-mode/v1/embeddings

Model输入:text-embedding-v3

Qwen与DeepSeek在本项目中的关系

目前DeepSeek的对话推理能力着实强大,此方法在一定程度上发挥了这个优势(其实个人感觉其实目前直接调用gpt更为方便。)

上面的图仅仅是示意,填写的内容按照文字或者是视频示意来。

上面是所有的配置,点击下方的test,如果出现以下内容则说明配置成功。


使用方法

随机选取一篇文献,点击图标

可见出现一个窗口,下面的一些命令可以快速提问,右键点击run即可运行该命令,如果碰到如下的报错,直接忽略,再次点击

后续再次切换一篇文章的时候会发现,llm仍然记得上一篇文章的信息

后续我尝试点击uploadPDF,发现出现报错

经过一些检索github-issue(AskPDF·问题 #204以及ask PDF ·问题 #390)发现这个问题普遍存在于Qwen的v3-embedding版本,且目前无法解决。(如果有大佬知道的话请在评论区告诉我,文章写得比较急,就没有进一步探索,感谢)

我尝试发现一个简单有效的方法就是继续重复的点击askPDF,此外还有不少功能,我在视频里面讲解就好了,大家也可以自己探索!


至此就是全部内容,值此新年,祝各位paper发发发!


声明:本文没有任何利益相关,仅仅是分享经验!


2月8日更新:

  • 目前deepseek api可以使用,大家可以通过上方链接DeepSeek | 深度求索直接进入
  • 上方对于askPDF的报错,大家可以尝试将embedding的模型v3更换成v2,或者换成其他模型,即可解决问题。
  • 部分同学无法使用科学上网,打开github官网,可以尝试在Zotero 插件商店 | Zotero 中文社区中下载插件。
  • 出现一些联网之类的报错,可以确认api key是否填写错误,或者梯子未关,或者是搜索zotero-gpt/issues来解决,查找问题。
  • 后续会考虑出一期本地部署的方案
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