当我们在分析多少X的数据量可以满足我们需求的时候,此时就需要从一个BAM文件当中,快速随机抽取一定比例的BAM文件了。命令非常简单,下面是随机抽取10%比例的BAM文件:
java -Xmx16g -jar picard.jar DownsampleSam I=input.bam O=output.bam P=0.1
当然,有的软件分析较大的BAM文件时,耗时比较久,此时需要比较小的BAM文件,也会使用到随机抽取。
当我们在分析多少X的数据量可以满足我们需求的时候,此时就需要从一个BAM文件当中,快速随机抽取一定比例的BAM文件了。命令非常简单,下面是随机抽取10%比例的BAM文件:
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当然,有的软件分析较大的BAM文件时,耗时比较久,此时需要比较小的BAM文件,也会使用到随机抽取。