RNA-seq助力探究地下水污染致大鼠DNA损伤的分子机制

稀土矿区位于中国北方内蒙古包头市，是世界上最大的稀土矿床，近几十年来，集约开采、精炼作业、尾矿库处置导致该矿区出现了许多生态环境问题【1,2】。有证据表明，该矿区是中国恶性肿瘤特别是肺癌死亡率最高的地区之一【3,4】。越来越多的学者注意到地下水中的有毒化合物会在生物体内积累和放大，造成长期和慢性的毒理学效应，这是无法通过物理和化学分析方法检测或评估的。因此，生物监测方法越来越受到重视和认可。因此，在本研究中，首先对稀土矿区地表水和地下水中的核心污染物成分进行了分析。然后从宏观到微观(器官-组织-细胞-染色体基因)构建SD大鼠遗传损伤的定量表征分析。最后，确定了地下水污染致遗传损伤的可能分子机制。

技术路线

1、水质成分调查

在研究区共采集了5个水样。S1和S2分别作为主矿400 m和东矿300 m的地下水采集点，这是目前主要的两个矿区。地表水位点(S3-S5)从近到远进行排序，城市饮用水作为标准对照组(样品S)。地下水污染的主要指标为重金属和稀土元素含量高，地表水污染的主要指标为稀土元素、总氮和氨氮(NH4+ -N)含量高。

2、鼠肝脏DNA损伤作用的生物学评价

称重并计算各器官系数，结果显示，对肝脏的影响比对其他器官的影响更为显著。进一步分析了金属元素和稀土元素在肝脏中的积累，部分金属元素(Mn、Ni、Cu、Zn、Cd)和稀土元素(Ce、Sc、Nd、Pr、Gd、Th)的富集差异极显著(p< 0.01)。

通过对6个处理过的肝脏样本进行免疫组织病理学分析，对照组无异常，而实验组肝组织结构发生炎症细胞浸润，中心静脉和胆管增生的改变，肝小叶中心静脉充血。 特