派森诺基因云不同类别数据如何做关联热图?

本文介绍了如何在派森诺基因云平台上创建关联热图,包括准备数据、提交绘图和参数调整等步骤,展示了如何实现物种丰度与生化因子间的相关性分析,并添加显著性标志。
摘要由CSDN通过智能技术生成

之前有跟大家分享过一篇文章《跟着nature 学作图:相关系数图从0→N》,对于相关系数图,相信大家并不陌生。近期有小伙伴说:相关系数图只能做样品之间的相关性分析,如果需要做物种丰度和生化因子或其它类别之间的相关性却实现不了,能否实现呢?能否在相关性图上加上显著性星星(***)呢?当然是可以的啊,如图1所示,快随小编一起去看看吧。
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图1 关联热图示例

首先,登入派森诺基因云(https://www.genescloud.cn/), 进入【云图汇→关联热图】

1、准备数据

准备图2, 图3 所示数据、因子文件。数据文件第一列对应分类名称,其它列为样品对应的数据;因子文件第一列为因子名称,其它列为样品对应的数据。

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图2 数据文件

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图3 因子文件

2、提交绘图

上传数据后,一键提交绘图即可。

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