猪伪狂犬病(Pseudorabies virus,PRV)是一种主要发生在猪身上的急性传染病,对全球养猪业造成了严重的威胁。现有的商业疫苗也未能防止新的PRV菌株出现。因此,迫切需要新的手段和策略来控制PRV的传播。
迄今为止,应用蛋白质组学来分析PRV-宿主细胞互作机制的研究还很少。因此本文采用TMT标记定量蛋白质组学方法来比较PRV感染后宿主细胞的蛋白表达差异,为进一步揭示PRV发病机制和潜在的抗病毒靶点提供理论依据。
技术线路
1、PRV诱导的细胞蛋白表达差异
为了分析PRV感染过程中宿主细胞蛋白表达量的变化,本文对ISG15-/–PK15细胞(ISG15敲除的PK15细胞)进行蛋白质组学分析(图1A)。在PRV和Mock比较组中,共鉴定出4958个肽段,筛选出241个差异表达蛋白(差异倍数>1.2或<0.83,P值<0.05),与Mock组相比,PRV感染的ISG15-/–PK15细胞中有162个差异蛋白显著上调,79个差异蛋白显著下调 (图1B)。